More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7273 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  73.91 
 
 		 1244 aa  712    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  65.43 
 
 		 953 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  63.57 
 
 		 1016 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  71.22 
 
 		 1058 aa  710    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  65.83 
 
 		 1040 aa  711    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  75.51 
 
 		 1007 aa  769    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  63.31 
 
 		 1151 aa  775    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  74.85 
 
 		 908 aa  750    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  72.45 
 
 		 1093 aa  757    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  74.21 
 
 		 959 aa  708    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  75.48 
 
 		 944 aa  753    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  71.78 
 
 		 952 aa  733    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  77.59 
 
 		 1117 aa  761    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  66.18 
 
 		 1080 aa  690    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  76.34 
 
 		 922 aa  781    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  75.88 
 
 		 1194 aa  779    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  63.53 
 
 		 1123 aa  689    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  73.89 
 
 		 974 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  74.63 
 
 		 1043 aa  744    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  65.56 
 
 		 987 aa  688    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  71.37 
 
 		 1265 aa  769    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  65.56 
 
 		 991 aa  687    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 1334 aa  2626    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  75.1 
 
 		 1427 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  76.32 
 
 		 990 aa  784    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  77.67 
 
 		 1041 aa  791    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  63.59 
 
 		 1113 aa  772    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  68.34 
 
 		 1091 aa  698    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  75.49 
 
 		 702 aa  731    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  70.6 
 
 		 1024 aa  707    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  71.43 
 
 		 1070 aa  707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  65.56 
 
 		 991 aa  687    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  66.93 
 
 		 961 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  62.5 
 
 		 1022 aa  606  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  60.13 
 
 		 1093 aa  589  1e-166  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  47.47 
 
 		 457 aa  405  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  45.12 
 
 		 559 aa  337  7e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  41.71 
 
 		 492 aa  333  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  43.17 
 
 		 562 aa  328  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  41.83 
 
 		 543 aa  327  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  43.91 
 
 		 636 aa  327  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  40.95 
 
 		 494 aa  323  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  43.51 
 
 		 564 aa  322  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  43.99 
 
 		 571 aa  314  6.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  41.98 
 
 		 531 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  41.26 
 
 		 497 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  41.26 
 
 		 497 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  41.28 
 
 		 483 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  42.96 
 
 		 496 aa  305  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  38.75 
 
 		 528 aa  304  8.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  38.23 
 
 		 496 aa  303  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  38.23 
 
 		 496 aa  303  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  41.69 
 
 		 503 aa  303  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  42.96 
 
 		 496 aa  302  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  39.72 
 
 		 503 aa  302  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  39.2 
 
 		 528 aa  300  9e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  45.05 
 
 		 485 aa  300  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  40.97 
 
 		 492 aa  299  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  44.83 
 
 		 485 aa  299  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  42.44 
 
 		 411 aa  298  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  42.29 
 
 		 490 aa  297  8e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  39.9 
 
 		 476 aa  297  9e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  36.64 
 
 		 1056 aa  297  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  45.16 
 
 		 485 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  42.26 
 
 		 500 aa  295  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  45.16 
 
 		 485 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  45.16 
 
 		 485 aa  295  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  36.43 
 
 		 926 aa  295  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  44.91 
 
 		 485 aa  295  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  43.48 
 
 		 490 aa  293  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  42.13 
 
 		 497 aa  293  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  37.71 
 
 		 1076 aa  292  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  41.01 
 
 		 489 aa  292  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  43.6 
 
 		 487 aa  292  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  41.01 
 
 		 489 aa  292  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  41.94 
 
 		 489 aa  292  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  40.58 
 
 		 489 aa  292  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  43.16 
 
 		 499 aa  291  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  39.34 
 
 		 501 aa  291  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  45.05 
 
 		 485 aa  291  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  38.46 
 
 		 483 aa  290  9e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  39.76 
 
 		 491 aa  290  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  45.16 
 
 		 485 aa  290  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.64 
 
 		 492 aa  290  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  40.34 
 
 		 496 aa  289  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  39.72 
 
 		 499 aa  289  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  45.16 
 
 		 485 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  39.76 
 
 		 495 aa  288  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  38.81 
 
 		 517 aa  287  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  43.87 
 
 		 1031 aa  287  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  38.8 
 
 		 485 aa  287  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  37.47 
 
 		 530 aa  287  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  40.44 
 
 		 489 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  42.18 
 
 		 496 aa  287  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  39.76 
 
 		 495 aa  287  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  41.87 
 
 		 495 aa  286  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  40.93 
 
 		 483 aa  285  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  35.11 
 
 		 1175 aa  285  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  38.46 
 
 		 1102 aa  285  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  43.2 
 
 		 493 aa  285  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>