86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7253 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  58.17 
 
 		 160 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 		 155 aa  167  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  59.21 
 
 		 156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  56.46 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  56.08 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  51.66 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  52.03 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  50.65 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 152 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 		 155 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  56.58 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  52 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  44.59 
 
 		 172 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 		 163 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  50.71 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 162 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 		 174 aa  123  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  44.65 
 
 		 324 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  37.37 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  33.87 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  33.87 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 324 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  33.87 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  34.23 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  34.23 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  34.23 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  34.23 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 583 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 320 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  46.77 
 
 		 473 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  39.68 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  30.23 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 142 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 326 aa  41.6  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 		 224 aa  41.6  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 273 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 		 536 aa  40.8  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  46.67 
 
 		 314 aa  40.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>