More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7249 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
377 aa  746    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  43.32 
 
 
407 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  41.94 
 
 
400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  44.74 
 
 
402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  39.31 
 
 
402 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  41.69 
 
 
387 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  41.5 
 
 
400 aa  242  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  43.12 
 
 
399 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  38.59 
 
 
424 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  36.46 
 
 
380 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  40.68 
 
 
398 aa  232  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  41.57 
 
 
374 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  39.45 
 
 
388 aa  230  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  40.55 
 
 
424 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  39.89 
 
 
372 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  37.8 
 
 
394 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  38.84 
 
 
402 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  40.86 
 
 
393 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  36.21 
 
 
371 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  39.16 
 
 
393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  38.89 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  35.28 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  39.84 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  32.78 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  35.07 
 
 
370 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  37.94 
 
 
389 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
371 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  38.3 
 
 
408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  35.38 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  33.06 
 
 
384 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  32.55 
 
 
423 aa  189  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  36.08 
 
 
404 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  35.36 
 
 
400 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  35.93 
 
 
467 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  31.97 
 
 
390 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  37.67 
 
 
388 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  34.59 
 
 
403 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  35.09 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  35.09 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  34.64 
 
 
398 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  33.42 
 
 
396 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  175  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  35.9 
 
 
411 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  36.07 
 
 
418 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  34.83 
 
 
496 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  35.26 
 
 
400 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  30.55 
 
 
415 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  34.48 
 
 
351 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  33.16 
 
 
396 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  30.03 
 
 
388 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  32.34 
 
 
393 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  35.86 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  29.37 
 
 
405 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  32.5 
 
 
434 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  29.33 
 
 
386 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  30.03 
 
 
395 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  30.99 
 
 
392 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  28.4 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.18 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.01 
 
 
397 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.27 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  25.45 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  28.28 
 
 
402 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.39 
 
 
388 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  27.46 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  27.46 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  28.02 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  28.79 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  26.96 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.33 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  27.82 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.6 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  26.5 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.95 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.13 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  29.09 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  28.96 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  30.63 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  24.34 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  21.39 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.96 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  29.51 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.81 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  26.55 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  28.21 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  30.79 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.89 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  22.81 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  22.81 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  27.59 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  22.95 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  22.95 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  27.75 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.31 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  28.31 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  22.64 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  27.91 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>