More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7236 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  56.67 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  55.71 
 
 		 227 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  50.92 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  46.5 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  43.63 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  44.07 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  35.71 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  36.16 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  29.25 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.11 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.08 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  38.1 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  39.05 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  36.8 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  31.76 
 
 		 400 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  27.32 
 
 		 783 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  38.4 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.94 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.88 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  28.06 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  28.36 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  37.76 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  29.09 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  27.41 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.53 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.53 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  20.49 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  38.46 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  40.24 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  27.41 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  28.15 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  32.31 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  30.84 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  35.14 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  33.98 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  35.24 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  42.35 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.04 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.61 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2346  putative methyltransferase protein  33.57 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  0.183128 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.38 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.36 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.14 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  34.29 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.47 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.18 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  37.8 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>