More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7227 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7227  small multidrug resistance protein  100 
 
 
104 aa  199  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8162  transporter  73.53 
 
 
106 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  68.27 
 
 
114 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  64.71 
 
 
109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 
101 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4238  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 
106 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.644322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  43.27 
 
 
106 aa  90.5  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 
104 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4733  transporter  56.25 
 
 
101 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  40.59 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.27 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
106 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
153 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  40.38 
 
 
107 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54110  transporter  54.17 
 
 
101 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  43.27 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  40.38 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
106 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 
104 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1212  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 
104 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0428006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  41.35 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  41.35 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  41.35 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  41.35 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  41.35 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  41.35 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  41.35 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  41.18 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  41.18 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  41.38 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40.38 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00930  cation/cationic drug transporter  39.6 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  42.16 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2970  small multidrug resistance protein  40.23 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  39 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2825  small multidrug resistance protein  40.23 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00910  cation/cationic drug transporter  48.04 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  43.18 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1533  small multidrug resistance protein  40.23 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.447662  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1722  small multidrug resistance protein  40.23 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  39.42 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2843  small multidrug resistance protein  40.23 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  39.22 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1683  small multidrug resistance protein  38.2 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656055  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1608  small multidrug resistance protein  38.2 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4237  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.492024  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  37.25 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  37 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1676  small multidrug resistance protein  39.08 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4260  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>