114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7188 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 115 aa  229  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  77.19 
 
 		 115 aa  176  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  63.48 
 
 		 115 aa  133  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  66.33 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  45.54 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  46.67 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  49.41 
 
 		 127 aa  84.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  46.79 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  45.36 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  46.39 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  42.31 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  40.21 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32.43 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  30.3 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.71 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  33.68 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  22.68 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  31.25 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.27 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.84 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  25.69 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  24.14 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.72 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  29.17 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  23.47 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  38.14 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  40.74 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  38.33 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  22.45 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.28 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  24.07 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13130  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  28.4 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  31.94 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  32.32 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  25.88 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  24.71 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  29.79 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  24.21 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  25.58 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  28.72 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  26.73 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.47 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.56 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  32.2 
 
 		 122 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 114 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  24 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  36.99 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  30.88 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  25.88 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  24.14 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  22.77 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2807  hypothetical protein  41.51 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.1 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>