More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7115 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7115  fumarate hydratase, class II  100 
 
 		 487 aa  988    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4865  fumarate hydratase  64.99 
 
 		 485 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0425  fumarate hydratase  62.79 
 
 		 498 aa  611  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1545  fumarate hydratase  61.64 
 
 		 485 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  62.58 
 
 		 482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1618  fumarate hydratase  57.98 
 
 		 485 aa  578  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  60.44 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  60.44 
 
 		 463 aa  568  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  60.18 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  63.74 
 
 		 487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  58.86 
 
 		 471 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  59.65 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  59.43 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1440  fumarate lyase  61.73 
 
 		 482 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  55.8 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  56.75 
 
 		 482 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  59.08 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  55.26 
 
 		 459 aa  540  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  58.64 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  55.26 
 
 		 459 aa  541  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 462 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  58.02 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  56.89 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  56.7 
 
 		 464 aa  532  1e-150  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  58.68 
 
 		 465 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  58.02 
 
 		 472 aa  534  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  58.85 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  58.42 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  58.11 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  59.21 
 
 		 475 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  58.46 
 
 		 463 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 464 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  57.77 
 
 		 468 aa  521  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  57.14 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  57.58 
 
 		 463 aa  521  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  55.46 
 
 		 510 aa  521  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  57.39 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  57.79 
 
 		 472 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  58.52 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0149  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 460 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  57.58 
 
 		 478 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  56.73 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  55.99 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  56.64 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  55.08 
 
 		 467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  53.95 
 
 		 461 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 466 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  54.17 
 
 		 461 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  57.58 
 
 		 472 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  57.52 
 
 		 463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  57.36 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  57.7 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  57.86 
 
 		 464 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 464 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  57.86 
 
 		 464 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  57.33 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  57.14 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  57.86 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  56.24 
 
 		 463 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  55.38 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  56.02 
 
 		 465 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  55.51 
 
 		 467 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  55.24 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  58.48 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  54.49 
 
 		 465 aa  511  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 464 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  56.04 
 
 		 462 aa  510  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  57.24 
 
 		 631 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  56.77 
 
 		 465 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  55.29 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  55.29 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  55.29 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  55.08 
 
 		 467 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  58.17 
 
 		 472 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  54.06 
 
 		 513 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  54.16 
 
 		 513 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  54.49 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  55.29 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>