More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7103 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  100 
 
 		 305 aa  599  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  61.46 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  61.97 
 
 		 303 aa  346  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.13 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  61.84 
 
 		 306 aa  342  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  58.8 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  56.29 
 
 		 348 aa  332  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.26 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  59.14 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  58 
 
 		 301 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  58.28 
 
 		 319 aa  325  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  56.72 
 
 		 368 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  57.62 
 
 		 306 aa  322  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  55.41 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  57.57 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  54.13 
 
 		 361 aa  316  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  56.52 
 
 		 314 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  57.1 
 
 		 300 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  57.1 
 
 		 300 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  57.1 
 
 		 300 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  55.92 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  59.2 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  57.57 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  55.41 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 312 aa  312  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  56.77 
 
 		 308 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  54.52 
 
 		 313 aa  310  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  57 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  55.26 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  56.48 
 
 		 314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  54.1 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  53.85 
 
 		 315 aa  305  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  54.79 
 
 		 313 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  53.92 
 
 		 314 aa  299  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  53.18 
 
 		 314 aa  298  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  52.17 
 
 		 319 aa  298  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  53.64 
 
 		 314 aa  298  7e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  56.33 
 
 		 301 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  52.96 
 
 		 322 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  52.51 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  54.18 
 
 		 313 aa  292  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  56.07 
 
 		 306 aa  291  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  53.18 
 
 		 309 aa  290  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  52.16 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  52.29 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  52.61 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.75 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  53.18 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  50.16 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  47.12 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  51 
 
 		 337 aa  268  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  61.28 
 
 		 398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  52.82 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  48.99 
 
 		 305 aa  261  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 298 aa  261  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  49.49 
 
 		 311 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  48.66 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  47.87 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  58.6 
 
 		 241 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  48.99 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.02 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 		 330 aa  245  8e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.68 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.21 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  44.22 
 
 		 457 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  44.93 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.61 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  56.28 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  49.67 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  46.2 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  43.39 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  53.08 
 
 		 496 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  44.67 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.83 
 
 		 238 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  50 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  44.44 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  42 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.03 
 
 		 350 aa  211  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  53.49 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  46.25 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  54.07 
 
 		 258 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  41.81 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  46.58 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  47.54 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  51.97 
 
 		 242 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  41.67 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  39.22 
 
 		 304 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  40.79 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.3 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  40.4 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  39.53 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  49.77 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  35.67 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>