More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6980 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 213 aa  404  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.17 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.17 
 
 		 209 aa  230  9e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.24 
 
 		 212 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.46 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 209 aa  221  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  59.22 
 
 		 207 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.46 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.85 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 212 aa  211  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  51.64 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.15 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  50.24 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.27 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.51 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.04 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  49.76 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  45.75 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.56 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.98 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  51.21 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.6 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.17 
 
 		 222 aa  174  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.87 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.96 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  49.08 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  46.95 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.8 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  50.24 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.58 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.26 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  43.26 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  47.09 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  46.26 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  43.46 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  45.33 
 
 		 228 aa  168  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.71 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.91 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.45 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  44.23 
 
 		 218 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  47.09 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.88 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  46.26 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.95 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  46.95 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.62 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  44.24 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.89 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  44.34 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.85 
 
 		 217 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.5 
 
 		 230 aa  161  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  42.79 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  45.75 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.89 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.39 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>