182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6873 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  100 
 
 		 589 aa  1208    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  52.81 
 
 		 737 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  47.22 
 
 		 583 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  43.02 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  43.73 
 
 		 612 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  35.75 
 
 		 558 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  35.88 
 
 		 535 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  33.22 
 
 		 568 aa  262  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  34.74 
 
 		 547 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  32.21 
 
 		 567 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  33.74 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  30.85 
 
 		 574 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  32.3 
 
 		 604 aa  194  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  29.95 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.81 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  29.71 
 
 		 433 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  31.9 
 
 		 532 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  30.04 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  32.33 
 
 		 535 aa  178  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 597 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  29.95 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  30.49 
 
 		 408 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  30.49 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  29.47 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  30.58 
 
 		 450 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  29.53 
 
 		 658 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  31.11 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  30.66 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  30.73 
 
 		 587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  30.07 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  27.69 
 
 		 677 aa  153  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  30.58 
 
 		 693 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  60.33 
 
 		 801 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  26.84 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  28.89 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  57.85 
 
 		 472 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  52.45 
 
 		 469 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  28.73 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  57.85 
 
 		 490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  25.93 
 
 		 411 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  58.68 
 
 		 498 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  28.81 
 
 		 727 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  25.76 
 
 		 408 aa  140  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  58.26 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  55.74 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  29.81 
 
 		 541 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  55.74 
 
 		 493 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.58 
 
 		 435 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  26.65 
 
 		 403 aa  134  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  27.78 
 
 		 399 aa  134  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  53.28 
 
 		 380 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  48.94 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  30.86 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  52.54 
 
 		 492 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  50.83 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  46.3 
 
 		 603 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  26.95 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  52.89 
 
 		 500 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  49.22 
 
 		 451 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.67 
 
 		 489 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  52.07 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  49.57 
 
 		 801 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  28.01 
 
 		 850 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  49.57 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  44.6 
 
 		 801 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  41.73 
 
 		 803 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  41.18 
 
 		 479 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  32.86 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  26.86 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  37.59 
 
 		 890 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  25.57 
 
 		 636 aa  97.8  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  40.71 
 
 		 417 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  32.02 
 
 		 634 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  23.29 
 
 		 1172 aa  94.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  43.31 
 
 		 373 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  35.34 
 
 		 414 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  35.83 
 
 		 426 aa  91.3  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  22.3 
 
 		 640 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.14 
 
 		 933 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  39.34 
 
 		 732 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  39.66 
 
 		 1207 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  39.13 
 
 		 446 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  37.7 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  37.1 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  37.12 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  23.63 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.12 
 
 		 627 aa  80.5  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  25.65 
 
 		 938 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.71 
 
 		 1072 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  38.46 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  38.89 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  28.63 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  24.33 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  33.62 
 
 		 1128 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.26 
 
 		 531 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  36 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.68 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.85 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>