169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6867 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  100 
 
 
479 aa  964    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  64.16 
 
 
492 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  43.75 
 
 
363 aa  286  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  43.03 
 
 
386 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  43.09 
 
 
614 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  36.34 
 
 
385 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  62.41 
 
 
801 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  61.98 
 
 
373 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  52.76 
 
 
803 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  51.54 
 
 
890 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.24 
 
 
933 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  48.89 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  51.24 
 
 
634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  49.18 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  52.07 
 
 
380 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  49.14 
 
 
489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  50 
 
 
446 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  49.17 
 
 
452 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.76 
 
 
1072 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  51.24 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  48.25 
 
 
801 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  51.24 
 
 
451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  46.67 
 
 
568 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  48.48 
 
 
461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  41.18 
 
 
589 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  48.31 
 
 
558 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  40.33 
 
 
603 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  44.06 
 
 
417 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  46.88 
 
 
732 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  45.69 
 
 
374 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  45.61 
 
 
1207 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  42.07 
 
 
567 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.28 
 
 
498 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  45.38 
 
 
468 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  45.24 
 
 
516 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  40.71 
 
 
368 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  40.54 
 
 
490 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.61 
 
 
493 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  45.69 
 
 
497 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  42.37 
 
 
426 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.28 
 
 
489 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  43.44 
 
 
709 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  46.34 
 
 
535 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 
391 aa  100  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  45.08 
 
 
472 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.1 
 
 
627 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  41.3 
 
 
801 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  44.17 
 
 
488 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  44.17 
 
 
522 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  39.64 
 
 
548 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  41.18 
 
 
414 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.8 
 
 
500 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  42.98 
 
 
547 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  40.48 
 
 
1128 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  43.59 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  41.22 
 
 
165 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.72 
 
 
531 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  38.05 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  30.48 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.208592 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  30.27 
 
 
462 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20974 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.59 
 
 
580 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.22 
 
 
815 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  31.13 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  26.95 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  33.09 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  23.94 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  39.32 
 
 
1577 aa  76.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  31.33 
 
 
642 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04504  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  29.02 
 
 
632 aa  73.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.289237  normal  0.827131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.61 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03049  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  27.54 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  45.78 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  38.24 
 
 
574 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  27.31 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87647  filamentous growth, cell polarity and elongation  26.92 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  35.65 
 
 
597 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  32.2 
 
 
465 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  31.79 
 
 
644 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.88 
 
 
1016 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  26.03 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  31.52 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  45.68 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  38.38 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  35.25 
 
 
569 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  35.97 
 
 
824 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  30.43 
 
 
737 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  34.62 
 
 
494 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  35.29 
 
 
653 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.45 
 
 
756 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  32.14 
 
 
382 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  29.14 
 
 
613 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  23.95 
 
 
464 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  25 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  32.65 
 
 
493 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08421  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  27.45 
 
 
452 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.259019  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  32.75 
 
 
186 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  35.11 
 
 
494 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  31.61 
 
 
1139 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  43.21 
 
 
672 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>