More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6839 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
253 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.92 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.74 
 
 
247 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 
261 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  55.28 
 
 
249 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.69 
 
 
249 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2813  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.24 
 
 
254 aa  255  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.72 
 
 
246 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.72 
 
 
246 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4359  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.84 
 
 
249 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4227  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.84 
 
 
249 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0112  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.43 
 
 
249 aa  250  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0456  short-chain dehydrogenase  57.14 
 
 
243 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.6 
 
 
248 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4155  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.43 
 
 
249 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5464  short-chain dehydrogenase  57.14 
 
 
243 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0590758 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.3 
 
 
246 aa  248  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.75 
 
 
248 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.4 
 
 
245 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.5 
 
 
249 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.08 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.26 
 
 
246 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0158219  normal  0.051875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.88 
 
 
246 aa  241  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.0656338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
246 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.67 
 
 
249 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.52 
 
 
248 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.2 
 
 
243 aa  239  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37322  normal  0.510566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.56 
 
 
246 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.42 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
246 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.72 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.61 
 
 
246 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.2 
 
 
246 aa  235  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.184809  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.42 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.264822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.62 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02300  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.06 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257704  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.26 
 
 
247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 
246 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.53 
 
 
245 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
246 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0262  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.88 
 
 
250 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.520001  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.24 
 
 
251 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.24 
 
 
251 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.24 
 
 
251 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.2 
 
 
246 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521218  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
250 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
246 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.03 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 
248 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424016  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.05 
 
 
247 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.73 
 
 
246 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202973  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
247 aa  214  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.62 
 
 
246 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 
246 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3874  short chain dehydrogenase  48.77 
 
 
256 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122974  normal  0.933314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5033  short chain dehydrogenase  49.38 
 
 
253 aa  205  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
248 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
249 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.39 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881664  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1476  oxidoreductase  44.68 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1798  oxidoreductase  44.26 
 
 
237 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0401257  normal  0.0380539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1860  oxidoreductase  44.26 
 
 
237 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1657  oxidoreductase  44.26 
 
 
237 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
255 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1800  oxidoreductase  43.83 
 
 
237 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.419385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
248 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332665  normal  0.273672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0085  oxidoreductase  42.39 
 
 
237 aa  178  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.689145  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 
250 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
242 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.162466 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4821  oxidoreductase  42.68 
 
 
237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3763  oxidoreductase  42.68 
 
 
237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.26 
 
 
247 aa  172  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5771  oxidoreductase  42.26 
 
 
237 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4835  oxidoreductase  41.84 
 
 
237 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
247 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.15 
 
 
247 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.03 
 
 
247 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4505  oxidoreductase  41.84 
 
 
237 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04116  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  41.84 
 
 
237 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04080  hypothetical protein  41.84 
 
 
237 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2664  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  44.94 
 
 
255 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4729  oxidoreductase  40.59 
 
 
237 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
249 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
263 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.34 
 
 
248 aa  164  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.87 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
247 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2597  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.12 
 
 
248 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.87 
 
 
246 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.15 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
254 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.46 
 
 
246 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.46 
 
 
246 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>