125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6803 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  100 
 
 
592 aa  1174    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
1113 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  47.11 
 
 
578 aa  452  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
1100 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  45.16 
 
 
1098 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
1100 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
1094 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
1101 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
1172 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
1111 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  40.37 
 
 
701 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
1112 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
1112 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
1120 aa  362  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
1138 aa  352  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  51.34 
 
 
656 aa  353  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  48.49 
 
 
643 aa  351  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  37.08 
 
 
917 aa  344  2.9999999999999997e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  41.26 
 
 
599 aa  335  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  39.92 
 
 
1147 aa  333  6e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
1132 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 
1118 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  31.08 
 
 
597 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  34.29 
 
 
938 aa  163  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  24.01 
 
 
556 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  25.39 
 
 
556 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  25.39 
 
 
556 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.08 
 
 
859 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.08 
 
 
859 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  25.61 
 
 
568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  26.77 
 
 
858 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  29.33 
 
 
484 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  26.46 
 
 
861 aa  127  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  26.46 
 
 
861 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  26.15 
 
 
861 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  26.15 
 
 
861 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  26.15 
 
 
861 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  26.15 
 
 
861 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.15 
 
 
861 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.15 
 
 
861 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  25.22 
 
 
863 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.16 
 
 
851 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  25.05 
 
 
863 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  27.36 
 
 
854 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  23.49 
 
 
861 aa  110  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  22.3 
 
 
875 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.18 
 
 
844 aa  108  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  26.54 
 
 
854 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  23.55 
 
 
851 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  23.55 
 
 
851 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  23.12 
 
 
857 aa  105  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  23.92 
 
 
569 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  25.08 
 
 
847 aa  103  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  31.25 
 
 
872 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  23.63 
 
 
395 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  20.61 
 
 
852 aa  103  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  25.66 
 
 
879 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  23.37 
 
 
839 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  26.24 
 
 
880 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  27.55 
 
 
880 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  21.7 
 
 
862 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  25.14 
 
 
723 aa  97.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  25.97 
 
 
880 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  29.06 
 
 
880 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  29.06 
 
 
880 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  24.85 
 
 
850 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  25.14 
 
 
844 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  28.21 
 
 
880 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  22.71 
 
 
840 aa  91.7  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  25.82 
 
 
346 aa  91.3  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  27.3 
 
 
875 aa  90.5  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  22.22 
 
 
590 aa  90.5  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  25.91 
 
 
869 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  25.14 
 
 
864 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  27.96 
 
 
883 aa  88.6  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  22.16 
 
 
813 aa  89  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  24.29 
 
 
905 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  27.72 
 
 
881 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  26.99 
 
 
877 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  26.87 
 
 
429 aa  86.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  26.99 
 
 
877 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  21.95 
 
 
881 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  27.21 
 
 
866 aa  84.7  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  27.46 
 
 
881 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  25.85 
 
 
864 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  25.37 
 
 
889 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  25.37 
 
 
889 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  25.37 
 
 
889 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  23.99 
 
 
850 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  23.15 
 
 
850 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  23.49 
 
 
850 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  23.49 
 
 
850 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  25.52 
 
 
864 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  23.15 
 
 
850 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  26.77 
 
 
877 aa  82  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  21.82 
 
 
840 aa  82  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  21.82 
 
 
840 aa  82  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  27.02 
 
 
870 aa  81.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  26.94 
 
 
871 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  26.94 
 
 
871 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>