29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6725 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  100 
 
 		 576 aa  1154    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  38.95 
 
 		 1131 aa  386  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  40.86 
 
 		 753 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  38.06 
 
 		 793 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  38.35 
 
 		 792 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  33.75 
 
 		 1003 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  33.57 
 
 		 985 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  35.32 
 
 		 797 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  30.82 
 
 		 791 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  27.08 
 
 		 1072 aa  248  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  26.5 
 
 		 809 aa  243  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  26.5 
 
 		 809 aa  243  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  27.44 
 
 		 739 aa  223  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  30.86 
 
 		 892 aa  207  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0117  Hyaluronate lyase  26.17 
 
 		 618 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  29.98 
 
 		 846 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  26.85 
 
 		 700 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  27.59 
 
 		 693 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  25.44 
 
 		 718 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  30.84 
 
 		 533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.17 
 
 		 929 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  28.62 
 
 		 636 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2838  Lyase catalytic  21.95 
 
 		 1077 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  23.59 
 
 		 1043 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  23.87 
 
 		 656 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  25.46 
 
 		 1030 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0946  polysaccharide lyase family protein 8  22.41 
 
 		 1024 aa  47.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3277  polysaccharide lyase family protein 8  22.29 
 
 		 1024 aa  44.3  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0997  lyase catalytic  22.29 
 
 		 1024 aa  44.3  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>