More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6713 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 342 aa  674    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1943  transcriptional regulator, LacI family  57.61 
 
 		 347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  53.61 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  52.21 
 
 		 339 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1756  transcriptional regulator, LacI family  51.78 
 
 		 357 aa  311  7.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  51.18 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2719  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  49.41 
 
 		 337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3109  transcriptional regulator, LacI family  45.86 
 
 		 337 aa  288  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  49.85 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  46.55 
 
 		 354 aa  285  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  48.66 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  46.29 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3308  LacI family transcription regulator  44.41 
 
 		 346 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3698  transcriptional regulator, LacI family  49.7 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  45.88 
 
 		 347 aa  276  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0426  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  51.8 
 
 		 366 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4388  LacI family transcription regulator  49.07 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4475  LacI family transcription regulator  49.07 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4769  LacI family transcription regulator  49.07 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  48.48 
 
 		 338 aa  259  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.35 
 
 		 333 aa  252  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  45.65 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2867  transcriptional regulator, LacI family  44.08 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0458283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29660  transcriptional regulator, LacI family  43.92 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2305  transcriptional regulator, LacI family  43.53 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28330  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 382 aa  222  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  40.83 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  40.65 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  41.09 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 		 335 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.93 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 347 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.01 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  36.01 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  32.75 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.53 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  38.3 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  38.32 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.01 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.98 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.01 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.65 
 
 		 353 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.2 
 
 		 347 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  34.34 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  35.01 
 
 		 333 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.73 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  38.05 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.64 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  32.43 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.16 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  34.02 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.5 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.13 
 
 		 348 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  37.95 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.53 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  36.72 
 
 		 357 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.34 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.07 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  35.77 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.84 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  37.06 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0329  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16025  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.44 
 
 		 352 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.63 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.63 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.44 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  30.68 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.71 
 
 		 355 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  38.64 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  38.12 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.66 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  38.62 
 
 		 348 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 346 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3698  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 331 aa  179  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.23 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  35.39 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.45 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2163  transcriptional regulator, LacI family  36.26 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  27.68 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  32.63 
 
 		 332 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  32.84 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>