18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6642 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6642  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0494552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  42.39 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  42.39 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  42.39 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  37.5 
 
 		 788 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0927  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  38.39 
 
 		 511 aa  64.3  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  43.43 
 
 		 777 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  40.22 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  38 
 
 		 544 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  37.63 
 
 		 374 aa  58.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  29.5 
 
 		 852 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  36.46 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  33.62 
 
 		 270 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  33.62 
 
 		 270 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  33.62 
 
 		 270 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0010  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  44.62 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  47.8  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  decreased coverage  0.00589237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0310  antifungal protein precursor, putative  36.23 
 
 		 230 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.375674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>