More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6606 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6606  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
552 aa  1059    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5554  major facilitator transporter  61.9 
 
 
550 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3786  major facilitator superfamily MFS_1  55.11 
 
 
560 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal  0.51855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0876  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 
532 aa  382  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.757243  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2415  transmembrane efflux protein  38.72 
 
 
525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
512 aa  230  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2253  major facilitator transporter  29.7 
 
 
546 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2131  major facilitator transporter  29.7 
 
 
529 aa  217  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.025245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2142  major facilitator transporter  29.51 
 
 
546 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3967  major facilitator transporter  27.13 
 
 
535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 
532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.96 
 
 
522 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 
539 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 
532 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.37 
 
 
524 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.96 
 
 
520 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 
502 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
518 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  29.79 
 
 
476 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 
458 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.71 
 
 
551 aa  158  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.72 
 
 
528 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.82 
 
 
509 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 
505 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.59 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1504  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 
541 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.14 
 
 
534 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  29.91 
 
 
490 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
477 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.58 
 
 
508 aa  148  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.32 
 
 
519 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 
551 aa  146  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  30.16 
 
 
517 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.92 
 
 
488 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.21 
 
 
452 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 
505 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  28.24 
 
 
519 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
463 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
501 aa  143  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3316  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 
550 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0200557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.56 
 
 
502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.86 
 
 
534 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.32 
 
 
540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.6 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  31.65 
 
 
457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
487 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.89 
 
 
489 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30480  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.8 
 
 
559 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.29 
 
 
545 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 
521 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 
524 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 
630 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  32.18 
 
 
471 aa  140  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.4 
 
 
487 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.87 
 
 
518 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  27.31 
 
 
516 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 
504 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.52 
 
 
467 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 
498 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  26.25 
 
 
554 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  29.48 
 
 
483 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.37 
 
 
474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 
527 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 
480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  28.23 
 
 
470 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.49 
 
 
478 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.1 
 
 
498 aa  137  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.42 
 
 
512 aa  136  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.36 
 
 
496 aa  136  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
520 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.25 
 
 
501 aa  136  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.92 
 
 
522 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 
763 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.15 
 
 
522 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  28.08 
 
 
493 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  26.95 
 
 
530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.08 
 
 
607 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
480 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 
788 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  24.61 
 
 
582 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.4 
 
 
583 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  29.88 
 
 
473 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  27.7 
 
 
462 aa  133  7.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  31.67 
 
 
475 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
484 aa  133  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.35 
 
 
484 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.86 
 
 
509 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.71 
 
 
585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  26.32 
 
 
514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  30.77 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  33.7 
 
 
444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 
479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>