More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6600 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  100 
 
 
490 aa  961  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  38.72 
 
 
494 aa  333  3e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  38.38 
 
 
467 aa  315  2e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  38.38 
 
 
467 aa  313  4e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  36.69 
 
 
499 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  36.67 
 
 
495 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  34.11 
 
 
473 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  35.46 
 
 
474 aa  285  1e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  35.33 
 
 
508 aa  283  4e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  34.63 
 
 
474 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  34.63 
 
 
474 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  34.11 
 
 
473 aa  274  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  33.77 
 
 
464 aa  273  4e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  33.77 
 
 
464 aa  272  9e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 
469 aa  267  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  33.97 
 
 
480 aa  266  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56631e-10 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  33.4 
 
 
473 aa  263  7e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  34.07 
 
 
466 aa  258  2e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  35.65 
 
 
495 aa  256  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  33.69 
 
 
470 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  33.69 
 
 
476 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  34.58 
 
 
506 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  34.03 
 
 
506 aa  235  2e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  28.85 
 
 
473 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  28.85 
 
 
473 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  28.85 
 
 
473 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  28.85 
 
 
473 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  28.85 
 
 
473 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  30.04 
 
 
472 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  30.04 
 
 
472 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  31.18 
 
 
475 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29 
 
 
511 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.77 
 
 
511 aa  190  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.77 
 
 
511 aa  190  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.77 
 
 
511 aa  190  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  28.77 
 
 
511 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  28.77 
 
 
511 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.77 
 
 
511 aa  190  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  28.77 
 
 
511 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.77 
 
 
511 aa  190  6e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  27.35 
 
 
503 aa  184  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  29.98 
 
 
475 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  27.99 
 
 
445 aa  181  3e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  27.78 
 
 
445 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  27.25 
 
 
485 aa  176  1e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  27.25 
 
 
485 aa  175  2e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  26.62 
 
 
511 aa  152  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 
720 aa  144  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  26.98 
 
 
494 aa  131  2e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  25.19 
 
 
472 aa  105  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  26.65 
 
 
495 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  26.39 
 
 
495 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 
464 aa  94  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  24.73 
 
 
489 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  3.67074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  24.47 
 
 
489 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 
455 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 
497 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3545  amino acid permease family protein  25 
 
 
477 aa  86.3  1e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4392  amino acid permease family protein  25 
 
 
477 aa  85.9  2e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3260  amino acid permease family protein  25 
 
 
477 aa  85.9  2e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0623  amino acid permease-associated region  25 
 
 
477 aa  85.1  3e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3372  amino acid permease family protein  24.4 
 
 
477 aa  84.7  4e-15  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 
500 aa  84  5e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  22.97 
 
 
500 aa  83.6  7e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  1.96904e-05 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  24.78 
 
 
477 aa  83.2  9e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0622  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 
477 aa  82.4  2e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  25 
 
 
477 aa  80.1  7e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 
481 aa  79  2e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 
496 aa  78.2  3e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  26.26 
 
 
782 aa  76.6  9e-13  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 
475 aa  70.5  7e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  24.33 
 
 
473 aa  69.7  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  24.33 
 
 
473 aa  69.7  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  24.33 
 
 
473 aa  69.7  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  24.33 
 
 
473 aa  69.7  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  24.33 
 
 
473 aa  69.7  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  23.74 
 
 
540 aa  67.8  4e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  23.74 
 
 
540 aa  67.8  4e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2046  amino acid permease family protein  24.89 
 
 
496 aa  67  7e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  23.6 
 
 
476 aa  67  7e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 
438 aa  67  7e-10  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 
476 aa  67  8e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 
476 aa  67  8e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  23.6 
 
 
476 aa  67  8e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  23.6 
 
 
476 aa  67  8e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  23.6 
 
 
476 aa  65.9  2e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  24.69 
 
 
502 aa  65.5  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2332  amino acid permease family protein  24.44 
 
 
496 aa  65.5  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0134  amino acid permease  24.85 
 
 
527 aa  64.7  3e-09  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.91384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  23.26 
 
 
476 aa  64.7  3e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1695  amino acid transporter  21.89 
 
 
480 aa  65.1  3e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00330646  decreased coverage  1.25344e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1311  amino acid transporter  23.94 
 
 
516 aa  64.3  4e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.30405e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  21.91 
 
 
501 aa  64.7  4e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.64 
 
 
489 aa  63.9  6e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1517  gamma-aminobutyrate permease  29 
 
 
507 aa  62.8  1e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 
487 aa  62  2e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 
490 aa  62  2e-08  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  24.1 
 
 
476 aa  62  2e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 
486 aa  62  2e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 
476 aa  61.6  3e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>