More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6532 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  71.57 
 
 		 320 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  67.44 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  65.35 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  66.45 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  63.33 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  64.24 
 
 		 315 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  64.98 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  63.55 
 
 		 314 aa  371  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  61.87 
 
 		 335 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  62.13 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  63.4 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  62.3 
 
 		 319 aa  368  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  62.29 
 
 		 301 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  62.09 
 
 		 310 aa  364  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  62.54 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  63.21 
 
 		 319 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  63.55 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  60.33 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  60 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.61 
 
 		 317 aa  352  7e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  60 
 
 		 313 aa  349  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  55.66 
 
 		 361 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  57.91 
 
 		 316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  60.33 
 
 		 304 aa  340  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  58.19 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  56.49 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  57.76 
 
 		 348 aa  339  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  60.74 
 
 		 309 aa  339  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  56.21 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  56.45 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  57.19 
 
 		 300 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  57.19 
 
 		 300 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  57.19 
 
 		 300 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  59.67 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  56.63 
 
 		 373 aa  328  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  59.93 
 
 		 305 aa  328  9e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  54.69 
 
 		 368 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  55.88 
 
 		 310 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  58.42 
 
 		 308 aa  322  7e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 310 aa  322  7e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  54.64 
 
 		 301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  55.22 
 
 		 318 aa  315  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  55.52 
 
 		 322 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  54.7 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  56.29 
 
 		 303 aa  309  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  55.41 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.18 
 
 		 305 aa  301  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  52.84 
 
 		 303 aa  300  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  56.52 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  67.91 
 
 		 252 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  66.82 
 
 		 241 aa  296  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  56.33 
 
 		 304 aa  292  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  60.47 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  50.17 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.16 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  48.51 
 
 		 330 aa  271  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  50.7 
 
 		 311 aa  268  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  49.15 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  49 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.15 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.26 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  45.08 
 
 		 457 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  59.26 
 
 		 244 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.74 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  46.92 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  49.49 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  48.81 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  49.15 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  47.06 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  49.01 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.05 
 
 		 238 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  46.18 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  45.92 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  53.99 
 
 		 234 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  49.35 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.08 
 
 		 350 aa  229  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.22 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 496 aa  225  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  44.77 
 
 		 303 aa  221  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  50 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  53.85 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  45.15 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.56 
 
 		 247 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  51.38 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  42.33 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  50.7 
 
 		 251 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  43.3 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  45.61 
 
 		 317 aa  205  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  42.68 
 
 		 389 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  40.31 
 
 		 409 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>