More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6450 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 241 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  74.79 
 
 		 247 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  75.11 
 
 		 239 aa  348  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  72.89 
 
 		 234 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  74.21 
 
 		 239 aa  346  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  69.33 
 
 		 227 aa  341  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  73.3 
 
 		 239 aa  340  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  72.77 
 
 		 231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  70.54 
 
 		 232 aa  334  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  70.72 
 
 		 228 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  69.64 
 
 		 230 aa  328  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  68.75 
 
 		 233 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  69.23 
 
 		 234 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  69.68 
 
 		 228 aa  325  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  68.78 
 
 		 234 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  68.75 
 
 		 230 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  69.6 
 
 		 233 aa  322  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  67.42 
 
 		 227 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  64 
 
 		 230 aa  318  3.9999999999999996e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  50.88 
 
 		 389 aa  239  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  52.44 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  57.14 
 
 		 240 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  53.7 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  51.83 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  54.34 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  53.85 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  54.34 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  53.88 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  53 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  50.88 
 
 		 222 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  50 
 
 		 228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  50.88 
 
 		 222 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  50.88 
 
 		 222 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  51.8 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  49.77 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  50.68 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  51.44 
 
 		 223 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  52.25 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  52.25 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  50.68 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  48.66 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  50.67 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  45.62 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  46.64 
 
 		 222 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  48.39 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  43.72 
 
 		 227 aa  196  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  47.3 
 
 		 225 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  50.23 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  36.24 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  36.1 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  32.46 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.37 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.58 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.58 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  35.79 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.65 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  38.02 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.94 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.14 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  35.79 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 201 aa  99.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.97 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 213 aa  91.7  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  32.24 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 193 aa  89  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 		 248 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 204 aa  88.6  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.84 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  31.94 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.73 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  37.07 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 197 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>