More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6432 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  100 
 
 		 160 aa  321  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  65.28 
 
 		 150 aa  206  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  64.44 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  62.77 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  63.24 
 
 		 144 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  57.78 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  60.56 
 
 		 157 aa  173  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  57.97 
 
 		 148 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  60.74 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  49.67 
 
 		 150 aa  160  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  46.81 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  43.94 
 
 		 144 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  46.32 
 
 		 141 aa  128  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  43.94 
 
 		 144 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  44.93 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  44.06 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  44.93 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  45.65 
 
 		 144 aa  124  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  42.75 
 
 		 146 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  41.73 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  41.43 
 
 		 146 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  42.11 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  45.11 
 
 		 145 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  38.69 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  43.48 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  40.71 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  41.13 
 
 		 144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  42.66 
 
 		 145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  42.66 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  40.28 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  43.08 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  42.86 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  40 
 
 		 144 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  35.71 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  36.3 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3742  thioredoxin  45.52 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  40.67 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  39.26 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  38.81 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  38.24 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  43.38 
 
 		 145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  39.16 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  39.72 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  40.74 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  38.24 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  39.39 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  33.1 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  47.47 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  38.67 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  42.34 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  40 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  36.69 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  46.46 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  38.41 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  44.34 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  37.5 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  45.63 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  41.67 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  46.46 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  43 
 
 		 119 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  42.31 
 
 		 107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  43 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  43 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  37.96 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  33.33 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  42 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  37.5 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  33.58 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  33.82 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  33.58 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  33.58 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  36.76 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  37.06 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  33.58 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  43.12 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  42.31 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  34.53 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  36.23 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  43.43 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  36.69 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  39.57 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  39.81 
 
 		 107 aa  105  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  44.23 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  33.58 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>