85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6408 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  100 
 
 
1375 aa  2706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  33.1 
 
 
1101 aa  273  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  31.28 
 
 
794 aa  215  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  30.26 
 
 
1147 aa  215  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  31.41 
 
 
1209 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  29 
 
 
1164 aa  194  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  28.66 
 
 
646 aa  188  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  28.93 
 
 
958 aa  164  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  28.7 
 
 
948 aa  162  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  36.45 
 
 
2031 aa  147  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  26.55 
 
 
2038 aa  137  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  32.71 
 
 
396 aa  126  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  26.79 
 
 
1037 aa  125  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  27.39 
 
 
2046 aa  119  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  29.79 
 
 
429 aa  111  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  32.07 
 
 
414 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  27.69 
 
 
420 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  30.47 
 
 
409 aa  104  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  28.57 
 
 
422 aa  103  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  29.68 
 
 
407 aa  94  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  29.49 
 
 
439 aa  94  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  27.54 
 
 
452 aa  93.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.88 
 
 
384 aa  92.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  28.61 
 
 
487 aa  92  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  29.41 
 
 
423 aa  91.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  27.18 
 
 
428 aa  91.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.39 
 
 
483 aa  91.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.39 
 
 
483 aa  91.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  27.39 
 
 
425 aa  90.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.39 
 
 
425 aa  90.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  27.39 
 
 
425 aa  90.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  27.39 
 
 
425 aa  90.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  26.36 
 
 
425 aa  89  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  25.92 
 
 
442 aa  89  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.13 
 
 
425 aa  88.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  28.61 
 
 
422 aa  88.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  27.79 
 
 
404 aa  87.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  28.2 
 
 
421 aa  87.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  28.88 
 
 
421 aa  86.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  29.06 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  27.94 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.94 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  26.98 
 
 
418 aa  84.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  27.11 
 
 
421 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  28.35 
 
 
2113 aa  84  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  27.36 
 
 
423 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  29.03 
 
 
422 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.53 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  27.87 
 
 
377 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  26.46 
 
 
407 aa  79  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  29.19 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  26.72 
 
 
414 aa  77  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  30.53 
 
 
1931 aa  76.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  24.31 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  27.03 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  28.23 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  30.47 
 
 
326 aa  74.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  23.99 
 
 
395 aa  73.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  28.25 
 
 
2447 aa  73.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  24.81 
 
 
450 aa  73.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.22 
 
 
1212 aa  72.4  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  26.34 
 
 
542 aa  70.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  25.26 
 
 
414 aa  66.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  24.27 
 
 
423 aa  66.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  30.7 
 
 
2585 aa  66.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  25.91 
 
 
430 aa  65.9  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  26.28 
 
 
437 aa  64.3  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  29.13 
 
 
1548 aa  64.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.66 
 
 
1357 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  27.68 
 
 
1465 aa  62.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  29.76 
 
 
508 aa  62  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  26.51 
 
 
864 aa  56.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  28.21 
 
 
727 aa  55.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  30.51 
 
 
778 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2597  hypothetical protein  27.44 
 
 
264 aa  54.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  29.96 
 
 
1176 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.15 
 
 
986 aa  50.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.15 
 
 
986 aa  50.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  28.15 
 
 
986 aa  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  28.15 
 
 
986 aa  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.15 
 
 
955 aa  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.15 
 
 
955 aa  50.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.15 
 
 
986 aa  50.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.15 
 
 
964 aa  47.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  27.4 
 
 
714 aa  46.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>