More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6400 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
389 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
400 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  38.91 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
415 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
392 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
391 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  25.92 
 
 
405 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.78 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
406 aa  96.3  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05650  glycosyltransferase  36.89 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.520529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
433 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
384 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  31.84 
 
 
406 aa  93.2  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
403 aa  93.2  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
373 aa  92.8  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  23.26 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
380 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  41.04 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
360 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
394 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
413 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
369 aa  89.7  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
414 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
445 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
410 aa  89.4  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  30.88 
 
 
413 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
458 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.51 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  38.98 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  38.31 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  29.65 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
468 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  38.1 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
381 aa  87  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
800 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 
386 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
382 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0297  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.39 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  40.26 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  33.33 
 
 
745 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
377 aa  86.3  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
381 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
374 aa  86.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
539 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  39.79 
 
 
482 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.43 
 
 
745 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  26.54 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  29.11 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  27.68 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  28.3 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
365 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  23.16 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  40.39 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.74 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  32.43 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>