274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6356 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
177 aa  361  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  80.79 
 
 
178 aa  295  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.8 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.51 
 
 
201 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.31 
 
 
181 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.64 
 
 
181 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.96 
 
 
180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.57 
 
 
201 aa  111  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  35.75 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.63 
 
 
204 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.37 
 
 
192 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  34.46 
 
 
181 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
188 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.31 
 
 
180 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  32.04 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  36.6 
 
 
180 aa  99  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.16 
 
 
179 aa  97.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 
208 aa  95.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.52 
 
 
182 aa  94.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.5 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  30.81 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.08 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.42 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.96 
 
 
183 aa  92  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  37.43 
 
 
190 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  34.53 
 
 
179 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.89 
 
 
217 aa  92.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.2 
 
 
209 aa  92  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
210 aa  92  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.14 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
189 aa  90.9  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
188 aa  90.9  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.59 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  35.15 
 
 
198 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.94 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30.34 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1772  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.89 
 
 
209 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  37.22 
 
 
181 aa  89  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.25 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.56 
 
 
183 aa  88.6  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  31.55 
 
 
215 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.89 
 
 
200 aa  87.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
197 aa  86.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.95 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  30.95 
 
 
204 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.25 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 
204 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.67 
 
 
196 aa  84.3  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.02 
 
 
176 aa  84.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.67 
 
 
178 aa  84  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.9 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  36.32 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.52 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.94 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  39.13 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.56 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  34.01 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.87 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  31.32 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.29 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.51 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  37.74 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  37.65 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.48 
 
 
221 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2274  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.9 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.85 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  36.91 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.02 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.62 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.19 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.89 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  34.55 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.54 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.75 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.98 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.54 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  39.22 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>