More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6331 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
480 aa  974    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.41 
 
 
474 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  34.69 
 
 
487 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.01 
 
 
451 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  37.21 
 
 
532 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.73 
 
 
476 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  36.62 
 
 
451 aa  209  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  32.91 
 
 
501 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.53 
 
 
466 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.85 
 
 
542 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  29.49 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.97 
 
 
472 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  33.62 
 
 
456 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  29.49 
 
 
444 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  30.04 
 
 
448 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.17 
 
 
459 aa  183  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  32.04 
 
 
461 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  31.59 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  32.53 
 
 
499 aa  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  30.85 
 
 
458 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.2 
 
 
461 aa  179  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  32.13 
 
 
474 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  33.76 
 
 
461 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  31.44 
 
 
479 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  34.27 
 
 
460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.25 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  30.36 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  32.54 
 
 
463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  34.48 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  31.55 
 
 
463 aa  173  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  28.57 
 
 
461 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.06 
 
 
449 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
477 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 
490 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  31.52 
 
 
465 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.64 
 
 
444 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  29.74 
 
 
462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  31.78 
 
 
478 aa  156  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.51 
 
 
464 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 
495 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  32.25 
 
 
456 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  34.35 
 
 
479 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  30.45 
 
 
462 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.49 
 
 
705 aa  153  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  30.62 
 
 
469 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 
446 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.76 
 
 
473 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.98 
 
 
461 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  30.38 
 
 
468 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  30.3 
 
 
461 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.97 
 
 
492 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  30.59 
 
 
476 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  30.8 
 
 
473 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.6 
 
 
473 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
758 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  30.37 
 
 
477 aa  140  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  29.17 
 
 
328 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.32 
 
 
469 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
754 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  31.78 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  29.19 
 
 
602 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  29.3 
 
 
470 aa  134  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  29.68 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  36.75 
 
 
563 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.65 
 
 
445 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  31.44 
 
 
461 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.03 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  29.32 
 
 
465 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.02 
 
 
490 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  23.73 
 
 
448 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  35 
 
 
465 aa  127  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.11 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 
764 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  31.15 
 
 
465 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.35 
 
 
484 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4048  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.37 
 
 
476 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.47 
 
 
447 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.97 
 
 
465 aa  123  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  28.7 
 
 
752 aa  123  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.13 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 
478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.48 
 
 
734 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  29.57 
 
 
466 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.47 
 
 
448 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  27.43 
 
 
753 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  27.7 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  30.75 
 
 
450 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.26 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.35 
 
 
896 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.35 
 
 
896 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  26.37 
 
 
462 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  35.85 
 
 
458 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  30.49 
 
 
775 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.86 
 
 
896 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  41.18 
 
 
545 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.81 
 
 
460 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  34.34 
 
 
894 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.15 
 
 
456 aa  110  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.95 
 
 
448 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>