201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6214 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 303 aa  611  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  58.9 
 
 		 310 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  61.87 
 
 		 288 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  59.21 
 
 		 288 aa  335  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  59.21 
 
 		 292 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  58.78 
 
 		 288 aa  331  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  58.82 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  57.91 
 
 		 285 aa  325  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  56.27 
 
 		 296 aa  325  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  57.95 
 
 		 302 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  57.91 
 
 		 295 aa  318  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  56.69 
 
 		 288 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  55.67 
 
 		 300 aa  315  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  53.82 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  57.61 
 
 		 301 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  56.34 
 
 		 288 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  56.46 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  55.72 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  54.96 
 
 		 290 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  52.6 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  53.76 
 
 		 292 aa  292  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  52.48 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  51.61 
 
 		 287 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  57.99 
 
 		 299 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  51.22 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  48.21 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  49.82 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  49.47 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  46.67 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  45.93 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  45.02 
 
 		 289 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  40.37 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  42.14 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  42.96 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  42.4 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  38.16 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  40.79 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  44.36 
 
 		 410 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  41.15 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  38.13 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  37.06 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  41.64 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  39.05 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  39.7 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  44.17 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  40.31 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  38.75 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 278 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 		 284 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  37.77 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  40.34 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  39.85 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.36 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.28 
 
 		 281 aa  168  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  37.06 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.86 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  39.48 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.74 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  36.75 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  35.62 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  37.87 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  34.81 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  36.26 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  33.1 
 
 		 278 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 319 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  34.91 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  38.87 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  35.02 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  44.89 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.36 
 
 		 283 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6444  putative transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 380 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504715  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  34.7 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  34.86 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  34.92 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1472  hypothetical protein  31.91 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  31.8 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  38.1 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.41 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  32.61 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  31.32 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  32.96 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1005  transcriptional regulator, XRE family  30.79 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>