More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6190 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  100 
 
 
406 aa  813    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  46.67 
 
 
409 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  48.53 
 
 
423 aa  298  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  46.91 
 
 
421 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  42.47 
 
 
404 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  35.99 
 
 
408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  37.16 
 
 
408 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38 
 
 
410 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.29 
 
 
414 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  36.47 
 
 
407 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  38.54 
 
 
417 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.05 
 
 
401 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  36.23 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  36.23 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.26 
 
 
402 aa  226  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  36.25 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  39.15 
 
 
450 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.67 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.11 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  35.48 
 
 
447 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  37.38 
 
 
464 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  35.44 
 
 
438 aa  210  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  34.99 
 
 
447 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  34.99 
 
 
447 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.22 
 
 
411 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  35.31 
 
 
443 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  36.18 
 
 
423 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  36.07 
 
 
409 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.01 
 
 
388 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.91 
 
 
405 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.99 
 
 
420 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  39.6 
 
 
416 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  34.69 
 
 
405 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.91 
 
 
426 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  35.93 
 
 
419 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.67 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.65 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  35.37 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  34.11 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  35.09 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.2 
 
 
408 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  36.13 
 
 
405 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.11 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  34.2 
 
 
411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  38.89 
 
 
409 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.69 
 
 
399 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  35.51 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  34.49 
 
 
406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  40.37 
 
 
398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  37.08 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  37.88 
 
 
417 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.1 
 
 
429 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.24 
 
 
406 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  35.84 
 
 
422 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  34.78 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  34.78 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  34.7 
 
 
400 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  34.47 
 
 
411 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  39.25 
 
 
407 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  34.47 
 
 
411 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  34.47 
 
 
411 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  32.82 
 
 
402 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  38.65 
 
 
423 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  36.16 
 
 
413 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  29.63 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  33.08 
 
 
402 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  34.78 
 
 
407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  33.42 
 
 
399 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  38.3 
 
 
408 aa  190  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  34.19 
 
 
399 aa  190  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.54 
 
 
411 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  36.42 
 
 
367 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.18 
 
 
400 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  34.36 
 
 
410 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  40.19 
 
 
400 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  32.17 
 
 
421 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.28 
 
 
422 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  32.92 
 
 
436 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  39.25 
 
 
408 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  36.68 
 
 
421 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  34.02 
 
 
417 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  29.14 
 
 
411 aa  186  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.45 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.61 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  38.37 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  39.44 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.6 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.53 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  35.51 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  36.48 
 
 
418 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  32.73 
 
 
398 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  32.62 
 
 
417 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  36.28 
 
 
395 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  35.34 
 
 
435 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  31.97 
 
 
415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  28.15 
 
 
411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.03 
 
 
412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.46 
 
 
412 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  38.15 
 
 
400 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  31.39 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>