63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6062 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.29 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.52 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  39.83 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.32 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1309  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.79 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226265  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.23 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3237  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.66 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.62 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 		 283 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 		 328 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.23 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  33.88 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.86 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.12 
 
 		 808 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  28.91 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  30.71 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 		 837 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.02 
 
 		 639 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.92 
 
 		 591 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.07 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2205  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.17 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.586211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.13 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  33.88 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.35 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.39 
 
 		 339 aa  48.5  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.72 
 
 		 265 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.59 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 		 292 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3092  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.53 
 
 		 387 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.51 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.42 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.22 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  28.15 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.89 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 		 370 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.42 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.97 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.95 
 
 		 319 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.42 
 
 		 233 aa  42  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.56 
 
 		 248 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.23 
 
 		 644 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.54 
 
 		 283 aa  41.6  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>