242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6006 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
315 aa  598  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  44.14 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 
297 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.7 
 
 
313 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.73 
 
 
308 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  38.43 
 
 
319 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.03 
 
 
301 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.98 
 
 
301 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  31.36 
 
 
301 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 
312 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  31.71 
 
 
303 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  35.14 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  30.85 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  30.85 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  30.85 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  30.85 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  36.75 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  30.51 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  30.42 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  30.51 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  30.85 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  37.1 
 
 
301 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  30.87 
 
 
303 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  30.51 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  32.37 
 
 
322 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  30.14 
 
 
307 aa  130  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  36.76 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  30.27 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  41.34 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.89 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.18 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.68 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  35.64 
 
 
293 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  33.94 
 
 
286 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  34.86 
 
 
296 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  33.23 
 
 
308 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  35.82 
 
 
292 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  28.67 
 
 
295 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  33.45 
 
 
307 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  31.51 
 
 
294 aa  123  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  35.13 
 
 
288 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  35.13 
 
 
288 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.57 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  33.55 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  33.1 
 
 
299 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  34.72 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  36 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  32.68 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  32.68 
 
 
358 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  27.72 
 
 
298 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.72 
 
 
289 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  34.15 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.44 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  31.46 
 
 
336 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  32.98 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  29 
 
 
304 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  35.13 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  34.8 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  30.63 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  31.4 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  37.04 
 
 
304 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  26.37 
 
 
307 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  33.57 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  33.56 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
300 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.76 
 
 
304 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 
308 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 
304 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  32.21 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  32.21 
 
 
307 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 
296 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 
318 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.76 
 
 
304 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  30.14 
 
 
299 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
290 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.79 
 
 
295 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.33 
 
 
294 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  32.6 
 
 
304 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  32.62 
 
 
317 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  28.78 
 
 
295 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
313 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  31.12 
 
 
303 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  29.15 
 
 
311 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 
343 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.27 
 
 
296 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  31.79 
 
 
288 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  30.07 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  28.04 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.27 
 
 
293 aa  99.4  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  31.32 
 
 
307 aa  99  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  28.72 
 
 
292 aa  99.4  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  32.13 
 
 
288 aa  99  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  29.23 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  33.22 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>