135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5998 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 81 aa  160  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.52 
 
 		 67 aa  73.6  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.44 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  49.3 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.11 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.48 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  49.3 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.7 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.7 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.11 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.68 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.89 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.89 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.39 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.89 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.06 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.48 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.77 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  44.93 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  48.61 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  48.61 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  48.61 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  33.8 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  33.8 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.03 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.47 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  41.77 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  39.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.66 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.25 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1457  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.41 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650778  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.84 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  33.8 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.66 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  33.8 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  33.8 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.47 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  33.8 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  33.8 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  33.8 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.03 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  38.03 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  32.39 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  38.03 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.21 
 
 		 347 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  36.62 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 66 aa  47.4  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.47 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  38.03 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  33.8 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  36.62 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  36.62 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  32.39 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07970  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.84 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00847854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  29.58 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.14 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  40.85 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  32.39 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  40.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.56 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  40.85 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  30.99 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  51.35 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>