More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5952 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  100 
 
 		 387 aa  781    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  61.92 
 
 		 386 aa  477  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  64.49 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  63.73 
 
 		 397 aa  454  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  64.51 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  64.04 
 
 		 382 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  64.38 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  62.24 
 
 		 387 aa  441  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.85 
 
 		 385 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  59.84 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  57.87 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  57.59 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.18 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  60.57 
 
 		 381 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  58.55 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  58.9 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  59.53 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.56 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  60.42 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  61.07 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  56.08 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  56.62 
 
 		 389 aa  401  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  53.95 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  53.63 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  53.37 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.82 
 
 		 413 aa  378  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  53.89 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.05 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  53.89 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  53.28 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  52.09 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  52.96 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  53.4 
 
 		 397 aa  358  7e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  51.17 
 
 		 383 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  54.35 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  48.02 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  51.18 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  48.05 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.93 
 
 		 408 aa  346  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  47.26 
 
 		 385 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  47 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  47.14 
 
 		 384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  47.14 
 
 		 384 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  51.32 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  49.49 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  49.87 
 
 		 384 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  49.61 
 
 		 383 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  49.33 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  49.87 
 
 		 395 aa  332  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  48.58 
 
 		 394 aa  329  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 395 aa  328  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  48.58 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  45.69 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  48.43 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  47.91 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  46.98 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  47.66 
 
 		 409 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  45.34 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  45.34 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  43.3 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  44.56 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  43.81 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  41.84 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  41.84 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  44.59 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 386 aa  309  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  41.58 
 
 		 386 aa  309  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  45.14 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  41.84 
 
 		 386 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  41.84 
 
 		 386 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  41.84 
 
 		 386 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  44.33 
 
 		 390 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  42.37 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  45.41 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 389 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  40.78 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  41.84 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  42.63 
 
 		 389 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  43.54 
 
 		 389 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  42.48 
 
 		 382 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  41.58 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  44.59 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  42.37 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  46.89 
 
 		 391 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  44.39 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  43.8 
 
 		 382 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  41.32 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  44.16 
 
 		 393 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  43.72 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  45.16 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  43.27 
 
 		 390 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  42.71 
 
 		 379 aa  300  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  43.86 
 
 		 384 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 382 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  43.86 
 
 		 391 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  43.86 
 
 		 391 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>