40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5922 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  31.2 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  34.27 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  29.26 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  25.56 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  27.11 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  25.12 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  29.86 
 
 		 224 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  26.91 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  31.17 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  26.47 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  27.67 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  29.78 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  25.59 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  25.59 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  25.59 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  26.79 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  22.11 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  26.51 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  24.75 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  23.53 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  21.37 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  23.21 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  23.91 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  29.63 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  24.6 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  27.4 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  25.64 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  23.58 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  21.49 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  23.4 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  26.12 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  23.56 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  22.6 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2735  Colicin V production protein  26.61 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  23.39 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  26.89 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  21.58 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  29.36 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  25.3 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>