265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5907 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  100 
 
 
308 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  43.55 
 
 
312 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1711  ribokinase-like domain-containing protein  39.37 
 
 
326 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3537  1-phosphofructokinase  44.21 
 
 
331 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0565479  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1164  1-phosphofructokinase  42.49 
 
 
353 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  34.19 
 
 
307 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  41.13 
 
 
325 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2359  1-phosphofructokinase  48.16 
 
 
301 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  33.78 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  29.74 
 
 
310 aa  146  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.55 
 
 
307 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  29.97 
 
 
311 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  34.69 
 
 
311 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 
315 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  36.22 
 
 
315 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2158  PfkB domain protein  43.39 
 
 
327 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 
316 aa  139  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16680  1-phosphofructokinase  40.25 
 
 
312 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  35.08 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.09 
 
 
315 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.34 
 
 
315 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  31.48 
 
 
303 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  40.68 
 
 
316 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  31.49 
 
 
310 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  31.49 
 
 
310 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  37.45 
 
 
314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  40.31 
 
 
313 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  35.74 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  38.43 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  39.77 
 
 
313 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  34.2 
 
 
308 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  34.31 
 
 
306 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 
324 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  33.68 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  33.12 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2297  1-phosphofructokinase  38.31 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  33.79 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  38.46 
 
 
325 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.48 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  34.29 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  35.03 
 
 
315 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.99 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  31.96 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  34.7 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  40.28 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  31.29 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  34.92 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  27.87 
 
 
308 aa  126  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  34.02 
 
 
310 aa  126  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  35.86 
 
 
333 aa  125  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.8 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  33.96 
 
 
320 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  34.34 
 
 
314 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  32.27 
 
 
308 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  34.07 
 
 
314 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  37.13 
 
 
314 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  33.54 
 
 
325 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  36 
 
 
312 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 
315 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 
303 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 
303 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 
303 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  31.18 
 
 
303 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 
303 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  32.26 
 
 
311 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  36.89 
 
 
312 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  29.31 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  32.59 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  36.63 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  28.97 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  31.56 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  31.02 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  32.67 
 
 
313 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 
311 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  36.39 
 
 
320 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  34.81 
 
 
318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  33.78 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  35.97 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.24 
 
 
306 aa  119  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31.53 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  32.3 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  27.65 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  28.86 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  29.17 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  28.05 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  28.19 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  28.19 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  31.68 
 
 
313 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  29.17 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  37.7 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  35.42 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  35.42 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  35.42 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.151366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>