More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5900 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
543 aa  1093    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  47.73 
 
 
539 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  49.37 
 
 
502 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  47.94 
 
 
512 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  47.95 
 
 
500 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  47.95 
 
 
500 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  50.55 
 
 
503 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  48.48 
 
 
518 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  44.73 
 
 
522 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  44.25 
 
 
557 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  49.06 
 
 
501 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  43.32 
 
 
551 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  44.5 
 
 
554 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  44.28 
 
 
532 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  42.17 
 
 
525 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  42.55 
 
 
526 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  40.47 
 
 
532 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3891  acyl-CoA synthetase  43.15 
 
 
527 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3877  acyl-CoA synthetase  43.15 
 
 
527 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3965  acyl-CoA synthetase  43.15 
 
 
527 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551618  normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  42.86 
 
 
549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 
613 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 
572 aa  196  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 
708 aa  187  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.85 
 
 
534 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 
520 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.85 
 
 
534 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.8 
 
 
545 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 
525 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 
509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.4 
 
 
608 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  33.62 
 
 
547 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 
807 aa  156  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 
532 aa  156  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  33.53 
 
 
553 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.82 
 
 
535 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 
512 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.88 
 
 
600 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7061  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 
513 aa  150  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131857 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 
553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.85 
 
 
601 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 
536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 
546 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 
495 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.67 
 
 
517 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.47 
 
 
517 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.98 
 
 
609 aa  147  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 
505 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.47 
 
 
517 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.47 
 
 
517 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.08 
 
 
517 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.21 
 
 
592 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.85 
 
 
537 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
509 aa  143  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.94 
 
 
592 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.94 
 
 
592 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.18 
 
 
538 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 
560 aa  141  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.01 
 
 
600 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26640  long-chain-acyl-CoA synthetase  34.02 
 
 
608 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.29 
 
 
514 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.33 
 
 
608 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2261  long-chain-acyl-CoA synthetase  33.16 
 
 
608 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.982772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29 
 
 
509 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.7 
 
 
550 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 
603 aa  138  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 
501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 
585 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 
512 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.65 
 
 
605 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 
499 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.63 
 
 
621 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 
524 aa  136  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1728  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.1 
 
 
612 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 
517 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 
507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2677  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
544 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.15 
 
 
510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.15 
 
 
510 aa  134  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.15 
 
 
510 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.35 
 
 
510 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.2 
 
 
662 aa  133  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.81 
 
 
596 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.15 
 
 
510 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.95 
 
 
510 aa  133  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.15 
 
 
510 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.15 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.15 
 
 
510 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.29 
 
 
510 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
510 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.95 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 
539 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.19 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.23 
 
 
491 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  31.38 
 
 
4930 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.11 
 
 
597 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06649  very-long-chain acyl-CoA synthetase family protein (CefD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03630)  30.05 
 
 
710 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.31 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>