More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5889 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  100 
 
 		 427 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  52.01 
 
 		 378 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.22 
 
 		 369 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  48.14 
 
 		 383 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  45.33 
 
 		 411 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.82 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  48.41 
 
 		 440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.19 
 
 		 356 aa  308  9e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  48.93 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  44.03 
 
 		 452 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  45.79 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  47.53 
 
 		 412 aa  289  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.66 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.66 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.66 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.52 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  48.24 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  41.65 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  70.45 
 
 		 363 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.05 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.09 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  46.54 
 
 		 218 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  48.6 
 
 		 215 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  67.19 
 
 		 366 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  59.38 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  60 
 
 		 137 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 235 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 208 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  36.23 
 
 		 243 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 209 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.52 
 
 		 213 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 253 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 214 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 200 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 213 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 223 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.85 
 
 		 213 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.93 
 
 		 196 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 213 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 220 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 234 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  35.58 
 
 		 229 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  35.41 
 
 		 220 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 220 aa  99.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  35.41 
 
 		 220 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.93 
 
 		 229 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.22 
 
 		 203 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  47.69 
 
 		 133 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  27.5 
 
 		 200 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33 
 
 		 201 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 226 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 211 aa  99  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 202 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.22 
 
 		 203 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 226 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.02 
 
 		 205 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  44.44 
 
 		 253 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 		 224 aa  97.8  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 220 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 220 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 220 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  44.44 
 
 		 253 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  34.93 
 
 		 229 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 222 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  38.3 
 
 		 198 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.42 
 
 		 222 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 221 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 220 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 221 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 205 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 213 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 221 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 207 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  43.65 
 
 		 168 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 212 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.17 
 
 		 200 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  42.86 
 
 		 254 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 202 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 223 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.09 
 
 		 203 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.09 
 
 		 203 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.09 
 
 		 203 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  43.9 
 
 		 232 aa  93.6  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 		 232 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 201 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 201 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  37.75 
 
 		 210 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 200 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.97 
 
 		 227 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 212 aa  90.9  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  42.97 
 
 		 197 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  40.35 
 
 		 243 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.16 
 
 		 200 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.16 
 
 		 200 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.22 
 
 		 203 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 229 aa  89.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>