117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5872 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  294  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  70.63 
 
 
145 aa  219  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  67.83 
 
 
148 aa  210  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  67.13 
 
 
145 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  67.13 
 
 
145 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  62.24 
 
 
145 aa  201  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  65.03 
 
 
147 aa  199  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  66.43 
 
 
145 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  63.5 
 
 
360 aa  192  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  62.94 
 
 
145 aa  191  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  62.94 
 
 
146 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  56.64 
 
 
324 aa  170  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  50.69 
 
 
147 aa  156  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  54.17 
 
 
153 aa  153  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  53.79 
 
 
140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  54.55 
 
 
140 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  51.52 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1126  hypothetical protein  44.76 
 
 
146 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.331179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  50.79 
 
 
134 aa  123  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  46.27 
 
 
138 aa  116  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  43.31 
 
 
144 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  47.66 
 
 
177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  42.52 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.77 
 
 
274 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  46.4 
 
 
133 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  38.76 
 
 
135 aa  103  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  38.76 
 
 
135 aa  102  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  39.06 
 
 
150 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  39.06 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  39.06 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  41.32 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  37.23 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  36.5 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  36.5 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  43.55 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  33.08 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  36.15 
 
 
150 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  39.25 
 
 
168 aa  94  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  36.92 
 
 
166 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.2 
 
 
306 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2456  hypothetical protein  34.53 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  36.42 
 
 
163 aa  93.2  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  40.14 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  38.73 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  36.88 
 
 
169 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  36.36 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  35.11 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  34.62 
 
 
311 aa  91.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  37.12 
 
 
145 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  34.62 
 
 
149 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  34.65 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  34.9 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  34.9 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  34.23 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  38.89 
 
 
157 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  35.83 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  37.61 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  38.58 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  38.58 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  38.58 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  36.89 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  36.3 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  42.37 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  40.19 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  40.19 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  40.19 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3405  hypothetical protein  36.7 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.460418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2352  hypothetical protein  36.8 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  37.69 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  33.09 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1838  hypothetical protein  35.51 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  37.4 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2156  hypothetical protein  38.93 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0172  hypothetical protein  35.54 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1728  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247315  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2718  hypothetical protein  38.1 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  34.62 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1332  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.223024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  39.5 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  36.72 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  36.45 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  36.72 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  36.45 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  36.72 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  36.45 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  37.96 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4262  hypothetical protein  29.2 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.877042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1820  hypothetical protein  32.26 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  30.3 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  36.67 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  34.51 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2738  hypothetical protein  30.84 
 
 
155 aa  67  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0877362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  37.17 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1321  hypothetical protein  33.64 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.641608  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0055  hypothetical protein  42.86 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  40.37 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2620  hypothetical protein  31.01 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00012961  normal  0.0164615 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>