147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5758 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
498 aa  1026    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  54.43 
 
 
464 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  52.05 
 
 
462 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  49.89 
 
 
457 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  49.78 
 
 
448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  48.68 
 
 
447 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  47.11 
 
 
451 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  48.88 
 
 
457 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  48.53 
 
 
448 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  44.17 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  44.96 
 
 
464 aa  392  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  46.9 
 
 
482 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  38.88 
 
 
485 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  36.39 
 
 
451 aa  257  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
450 aa  256  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  37.59 
 
 
450 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  37.59 
 
 
450 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
544 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  35.84 
 
 
453 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  35.99 
 
 
453 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  35.14 
 
 
432 aa  242  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 
452 aa  239  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 
449 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  35.49 
 
 
424 aa  236  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  34.73 
 
 
452 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  34.77 
 
 
452 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  34.38 
 
 
452 aa  233  7.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 
449 aa  229  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
440 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.5 
 
 
448 aa  193  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  33.08 
 
 
455 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 
444 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 
436 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 
447 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  30 
 
 
442 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 
447 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  29.94 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
445 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
495 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 
445 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.77 
 
 
435 aa  60.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 
445 aa  60.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.08 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 
441 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
433 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
419 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 
432 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
435 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
421 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 
428 aa  56.6  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
427 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 
417 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 
408 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
443 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
420 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
420 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
419 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  22.04 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
440 aa  53.9  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
419 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
451 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.21 
 
 
380 aa  53.5  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 
417 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
427 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 
451 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
428 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
434 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
419 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 
442 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 
454 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 
414 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.28 
 
 
431 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.17 
 
 
434 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
415 aa  51.2  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
422 aa  51.2  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
415 aa  50.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
428 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  20.48 
 
 
468 aa  50.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
493 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 
415 aa  50.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  26.13 
 
 
417 aa  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 
441 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
408 aa  50.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
439 aa  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.26 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  27.5 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>