More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5751 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  100 
 
 
356 aa  722    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  57.14 
 
 
355 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  57.14 
 
 
355 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  57.14 
 
 
355 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  56.23 
 
 
360 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  57.1 
 
 
376 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  54.49 
 
 
353 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  49 
 
 
365 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  48.02 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  48.02 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  49.44 
 
 
380 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  50 
 
 
365 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  49.12 
 
 
369 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  44.61 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  46 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  46.07 
 
 
363 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  47.97 
 
 
360 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  44.29 
 
 
363 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  43.63 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  47.41 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  40.73 
 
 
366 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  34.11 
 
 
357 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  33.53 
 
 
357 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  34.52 
 
 
357 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  33.63 
 
 
359 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  33.83 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  30.99 
 
 
351 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  30.99 
 
 
351 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  30.7 
 
 
351 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  30.75 
 
 
353 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  30.09 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  33.43 
 
 
357 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  32.79 
 
 
360 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
353 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
351 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  31.2 
 
 
358 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  32.46 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  35.62 
 
 
341 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  29.85 
 
 
353 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  33.55 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
343 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  30.29 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.02 
 
 
418 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  30.12 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  30.14 
 
 
348 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  29.34 
 
 
348 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  28.69 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
348 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  29.17 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  27.51 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
355 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  26.65 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
362 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
363 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  27.39 
 
 
416 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.71 
 
 
258 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
279 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
205 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.57 
 
 
266 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.86 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
340 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.77 
 
 
272 aa  60.1  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  26.67 
 
 
204 aa  59.3  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
273 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
285 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
285 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
204 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
267 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  30 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
263 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  33.94 
 
 
270 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  24.82 
 
 
285 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
202 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
305 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
257 aa  56.6  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
267 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
204 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
237 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
1162 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  26.88 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
246 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
272 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30 
 
 
1372 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  34.13 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  27.75 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.07 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  32.65 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  35.29 
 
 
268 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
204 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>