More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5722 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  100 
 
 		 320 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  71.57 
 
 		 314 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  69.84 
 
 		 306 aa  425  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  66.89 
 
 		 313 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  68.56 
 
 		 335 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  67.43 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  67.56 
 
 		 324 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.54 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  64.88 
 
 		 319 aa  397  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  66.78 
 
 		 313 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  64.92 
 
 		 346 aa  391  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  62.3 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  58.1 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  64.88 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  64.98 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  66.67 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  65.12 
 
 		 319 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  62.82 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  63.23 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  62.79 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  63.21 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  62.75 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.79 
 
 		 317 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  60.46 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  60.94 
 
 		 301 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  60 
 
 		 304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  59.87 
 
 		 368 aa  352  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  59.6 
 
 		 355 aa  351  8e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  61.07 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  58.88 
 
 		 373 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 312 aa  345  8e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  58.53 
 
 		 300 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  58.53 
 
 		 300 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  58.53 
 
 		 300 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  57.52 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.91 
 
 		 310 aa  328  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  54.69 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  55.52 
 
 		 303 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  56.38 
 
 		 301 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  56.81 
 
 		 322 aa  322  5e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  57.48 
 
 		 305 aa  322  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  53.44 
 
 		 318 aa  322  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  54.93 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  55.03 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  57.86 
 
 		 308 aa  319  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  55.22 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  55.12 
 
 		 306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.9 
 
 		 302 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.39 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.53 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  54.85 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  51.18 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  62.27 
 
 		 241 aa  292  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  58.96 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  51.75 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 330 aa  282  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  54.15 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  51.75 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  49.83 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  46.39 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.74 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.23 
 
 		 319 aa  254  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.92 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  48.81 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  45.14 
 
 		 302 aa  242  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  42.61 
 
 		 457 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.78 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  44.77 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  55.09 
 
 		 244 aa  235  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  44.67 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  55.91 
 
 		 242 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  52.58 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  50.23 
 
 		 238 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  46.1 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  43.2 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.84 
 
 		 299 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.9 
 
 		 350 aa  229  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  45.39 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  41.91 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  46.84 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 496 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  51.16 
 
 		 245 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  44.55 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  51.16 
 
 		 237 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  42.47 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  54.27 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.53 
 
 		 247 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.18 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  42.71 
 
 		 301 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  39.87 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.88 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.95 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>