170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5656 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  61.7 
 
 
840 aa  959    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  100 
 
 
824 aa  1638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  63.04 
 
 
756 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6727  hypothetical protein  37.84 
 
 
712 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840124  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  60.83 
 
 
884 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.43 
 
 
933 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.59 
 
 
1072 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  53.19 
 
 
672 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  39.81 
 
 
1016 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  69 
 
 
753 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  38.68 
 
 
726 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  59.8 
 
 
815 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  36.24 
 
 
1148 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  61.67 
 
 
788 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  60.44 
 
 
674 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.83 
 
 
489 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  45.67 
 
 
461 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  70.59 
 
 
710 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.67 
 
 
500 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.31 
 
 
493 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  44.09 
 
 
472 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  46.09 
 
 
380 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  39.01 
 
 
494 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.67 
 
 
498 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  43.61 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.75 
 
 
962 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  44.09 
 
 
490 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  43.75 
 
 
451 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.36 
 
 
507 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  43.75 
 
 
468 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  43.31 
 
 
801 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  58.24 
 
 
622 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  41.13 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  38.4 
 
 
943 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  39.37 
 
 
495 aa  76.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  28.35 
 
 
547 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  42.97 
 
 
489 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  38.51 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  61.45 
 
 
3244 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  42.97 
 
 
374 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35.43 
 
 
691 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.43 
 
 
474 aa  72.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  36.8 
 
 
548 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  57.32 
 
 
2079 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  58.02 
 
 
688 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  42.31 
 
 
1779 aa  72  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  36.23 
 
 
576 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.22 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  37.6 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  30.71 
 
 
571 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  34.92 
 
 
401 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  38.76 
 
 
368 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  41.86 
 
 
558 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.65 
 
 
520 aa  68.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  36.03 
 
 
566 aa  69.3  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  35.97 
 
 
479 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  27.35 
 
 
737 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  37.82 
 
 
603 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  33.6 
 
 
503 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  34.4 
 
 
412 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  62.92 
 
 
494 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  37.61 
 
 
427 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  32.48 
 
 
493 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  34.25 
 
 
589 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.56 
 
 
514 aa  66.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.65 
 
 
466 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  59.72 
 
 
778 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  39.81 
 
 
373 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  38.52 
 
 
801 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.07 
 
 
507 aa  65.1  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.93 
 
 
1321 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  36.3 
 
 
430 aa  64.3  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.84 
 
 
695 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.13 
 
 
476 aa  63.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  60.94 
 
 
592 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  38.26 
 
 
1338 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.34 
 
 
472 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  30.91 
 
 
1413 aa  62.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  30.66 
 
 
474 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  35.21 
 
 
482 aa  61.6  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  42.86 
 
 
582 aa  61.6  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  33.86 
 
 
957 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  33.07 
 
 
884 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  33.08 
 
 
1139 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  29.6 
 
 
487 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.86 
 
 
982 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  31.88 
 
 
1187 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  28.09 
 
 
963 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  43.37 
 
 
568 aa  58.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  31.48 
 
 
567 aa  57.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  29.84 
 
 
771 aa  57.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  34.65 
 
 
563 aa  57.8  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  35.51 
 
 
794 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  32.12 
 
 
411 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  32.28 
 
 
569 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7940  hypothetical protein  28.86 
 
 
573 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.65 
 
 
627 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  37.08 
 
 
510 aa  56.2  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  33.33 
 
 
863 aa  55.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  30.28 
 
 
615 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>