51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5598 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  100 
 
 		 95 aa  199  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  78.49 
 
 		 111 aa  156  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  76.34 
 
 		 113 aa  154  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  76.09 
 
 		 125 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  72.34 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  73.91 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  75 
 
 		 115 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  75 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  70.21 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  68.09 
 
 		 98 aa  137  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  65.62 
 
 		 116 aa  137  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  67.71 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  61.46 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  62.64 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  67.9 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2167  electron transport protein  69.23 
 
 		 99 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  56.52 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  59.78 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  60 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  57.14 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  59.49 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  54.17 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2091  electron transport protein  46.15 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  47.13 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  40.7 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  37.21 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  37.21 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  39.08 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  38.82 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  37.65 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  37.35 
 
 		 169 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  38.55 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  36.47 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  37.36 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  36.47 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  38.82 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  34.48 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  36.47 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  34.12 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  33.78 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  37.31 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  35.82 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  35.71 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  34.07 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  34.41 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  36.76 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  35.38 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  33.68 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  34.07 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  35.44 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>