More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5588 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  100 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  42.54 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.96 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  41.03 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  40 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  37.82 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  38.63 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 264 aa  161  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  40.07 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  38.93 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  38.57 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  38.57 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  37.64 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  40.07 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  40.67 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  38.26 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.76 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  37.83 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  38.49 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.85 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  43.51 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  39.62 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.81 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  35.4 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.15 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.05 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  34.77 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.07 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  35.64 
 
 		 259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.57 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  32.72 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.37 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.33 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  29.03 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.62 
 
 		 269 aa  92.4  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  29.81 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  27.24 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  31.12 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  29.18 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  30 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.24 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  29.66 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  29.66 
 
 		 269 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  32.62 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.42 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  30.55 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  32.63 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  25.35 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  29.86 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  28.83 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  28.06 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.7 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  25.8 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  28.72 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.94 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  28.32 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.7 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  27.7 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  27.7 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  28.03 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.36 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.57 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  23.05 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  27.66 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  30.8 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  27.63 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  26.62 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  25.81 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  31.94 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  27.72 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.12 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  28.67 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  22.71 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  26.71 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.12 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  34.91 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  26.28 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  28.32 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  31.14 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  28.11 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.73 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  28.32 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  28.42 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.29 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  27.73 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  26.3 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>