41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5533 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 
272 aa  538  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  42.69 
 
 
257 aa  194  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  51.43 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  51.43 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  51.43 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  45.86 
 
 
287 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  46.27 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  49.16 
 
 
287 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  46.18 
 
 
265 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  43.7 
 
 
297 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  40 
 
 
279 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7234  hypothetical protein  37.72 
 
 
460 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.273739  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0074  hypothetical protein  36.32 
 
 
358 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  26.03 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  26.32 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  28.97 
 
 
565 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  29.71 
 
 
582 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  24.64 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  21.56 
 
 
499 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  25.32 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  23.19 
 
 
547 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  26.62 
 
 
525 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  27.75 
 
 
230 aa  52.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  26.11 
 
 
278 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  24.83 
 
 
543 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  25 
 
 
543 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  30.32 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  24.85 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  26 
 
 
487 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  26.67 
 
 
503 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  26.67 
 
 
487 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  26.67 
 
 
487 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  26.67 
 
 
487 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  26.67 
 
 
503 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  26.67 
 
 
503 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  26.67 
 
 
503 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  28.28 
 
 
487 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  28.28 
 
 
487 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  31.2 
 
 
494 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  22.3 
 
 
228 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  21.3 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>