82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5396 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
302 aa  613  1e-174  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  56.61 
 
 
284 aa  315  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  53.56 
 
 
284 aa  306  2e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  51.7 
 
 
282 aa  305  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  54 
 
 
283 aa  304  1e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  54 
 
 
281 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  52.61 
 
 
286 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  55.07 
 
 
286 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  54.06 
 
 
306 aa  291  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  55.71 
 
 
294 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  54.95 
 
 
280 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  52.68 
 
 
290 aa  288  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  50.68 
 
 
292 aa  288  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  50.68 
 
 
296 aa  288  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  52.68 
 
 
286 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  7.87132e-05  hitchhiker  7.05422e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  54.01 
 
 
298 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  52.05 
 
 
283 aa  285  7e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  52.4 
 
 
285 aa  284  1e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  50.52 
 
 
296 aa  283  3e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  55.29 
 
 
280 aa  283  3e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  50.52 
 
 
296 aa  283  3e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  51.88 
 
 
289 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  50.17 
 
 
296 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  53.96 
 
 
283 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  50.52 
 
 
288 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  50.85 
 
 
289 aa  274  2e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  49.13 
 
 
301 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  50.33 
 
 
292 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  51.58 
 
 
279 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  48.06 
 
 
301 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  47.35 
 
 
301 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83665e-10 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  48.62 
 
 
286 aa  251  8e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  45.36 
 
 
296 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  45.05 
 
 
282 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  42.2 
 
 
297 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  43.01 
 
 
269 aa  222  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  46.48 
 
 
316 aa  215  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  39.8 
 
 
299 aa  201  1e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  37.95 
 
 
311 aa  190  3e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  33.1 
 
 
277 aa  162  8e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  1.6468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  34.89 
 
 
284 aa  128  1e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  30.69 
 
 
311 aa  114  2e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  31.11 
 
 
330 aa  111  2e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  29.45 
 
 
329 aa  110  2e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  30.42 
 
 
311 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  30.26 
 
 
311 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  32.58 
 
 
316 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  29.18 
 
 
298 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  28.12 
 
 
334 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  28.12 
 
 
334 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  28.12 
 
 
334 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  28.39 
 
 
313 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  27.54 
 
 
342 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  29.72 
 
 
348 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  27.12 
 
 
301 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  28.67 
 
 
324 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  27.04 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  26.95 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  28.96 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  28.8 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  28.62 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  27.18 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  28.67 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  28.66 
 
 
306 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  27.65 
 
 
312 aa  89.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  28.57 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  25.81 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  27.31 
 
 
312 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05047e-11 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  27.03 
 
 
325 aa  85.5  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  26.73 
 
 
312 aa  84.3  2e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  27.27 
 
 
307 aa  84.3  2e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  26.87 
 
 
312 aa  84.7  2e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  24.1 
 
 
307 aa  83.6  4e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  26.82 
 
 
310 aa  82.8  6e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  26.07 
 
 
312 aa  82.8  7e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  26.53 
 
 
310 aa  77.8  2e-13  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  25.6 
 
 
318 aa  75.5  1e-12  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  24.73 
 
 
353 aa  71.6  1e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  23.33 
 
 
319 aa  58.9  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  22.81 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_786  hypothetical protein  23.12 
 
 
278 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  21.71 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>