218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5362 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 403 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  46.43 
 
 		 398 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  33.51 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.91 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  38.3 
 
 		 403 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 391 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 400 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 390 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.96 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  30.9 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  33.21 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  32.2 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 391 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  29.06 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  31.88 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 377 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  31.79 
 
 		 462 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 392 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.29 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.89 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 430 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  29.78 
 
 		 404 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  31.96 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  31.58 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  32.31 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.08 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  29.87 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.81 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  27.69 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  27.42 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  27.42 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>