167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5330 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 438 aa  888    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  47.59 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  46.37 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  40.5 
 
 		 432 aa  335  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  37.79 
 
 		 433 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  39.5 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  38.24 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  38.44 
 
 		 435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  37.23 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  36.21 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  36.24 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  36.57 
 
 		 430 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 428 aa  230  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  34.99 
 
 		 438 aa  229  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  33.79 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  33.94 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  35.55 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  33.68 
 
 		 434 aa  222  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  34.09 
 
 		 441 aa  212  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  31.47 
 
 		 431 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  33.07 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  31.19 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  29.89 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.25 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  27.65 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 424 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.63 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  27.73 
 
 		 229 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.73 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 449 aa  87  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 440 aa  87  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  23.54 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.37 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  21.96 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.69 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.2 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.92 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.5 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  21.08 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.94 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.71 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.78 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.52 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0041  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 460 aa  57  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  29.11 
 
 		 157 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 504 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  20.83 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 464 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  21.77 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>