80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5218 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
542 aa  1072    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  53.02 
 
 
407 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  50.68 
 
 
416 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  43.33 
 
 
407 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  42.86 
 
 
439 aa  280  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  38.95 
 
 
420 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  41.88 
 
 
430 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  41.33 
 
 
377 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  40.21 
 
 
414 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  39.39 
 
 
442 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  39.9 
 
 
422 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  36.83 
 
 
415 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  38.66 
 
 
451 aa  247  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  40.05 
 
 
794 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  39.56 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  37.14 
 
 
404 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.39 
 
 
407 aa  243  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  40.36 
 
 
418 aa  240  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  37.44 
 
 
437 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  39.39 
 
 
409 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  39.39 
 
 
418 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  36.3 
 
 
450 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  35.98 
 
 
423 aa  226  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  36.75 
 
 
414 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  39.13 
 
 
422 aa  220  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  38.5 
 
 
452 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  37.6 
 
 
646 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  31.83 
 
 
414 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  38.13 
 
 
487 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  38.74 
 
 
423 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  74.07 
 
 
682 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  76.34 
 
 
723 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  36.45 
 
 
421 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  35.81 
 
 
423 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  33.67 
 
 
428 aa  203  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  73.64 
 
 
1357 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  39.02 
 
 
396 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  35.4 
 
 
421 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.91 
 
 
421 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  37.91 
 
 
421 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  39.28 
 
 
422 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  71.09 
 
 
1176 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  35.98 
 
 
421 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  34.93 
 
 
425 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  34.93 
 
 
425 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  34.93 
 
 
425 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  34.93 
 
 
425 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  34.93 
 
 
425 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  34.93 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.93 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  34.13 
 
 
395 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  37.36 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  56 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  31.2 
 
 
425 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  53.71 
 
 
632 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  38.81 
 
 
326 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.94 
 
 
384 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  57.48 
 
 
384 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  52.8 
 
 
358 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  24.87 
 
 
376 aa  127  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  53.33 
 
 
438 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  40.28 
 
 
220 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  51.97 
 
 
459 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.88 
 
 
673 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  26.43 
 
 
399 aa  103  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.09 
 
 
734 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.38 
 
 
627 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  34.92 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  31.5 
 
 
552 aa  70.5  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  26.34 
 
 
1375 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.96 
 
 
558 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  34.19 
 
 
1115 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  32.48 
 
 
409 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.92 
 
 
603 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  29.46 
 
 
1010 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  34.15 
 
 
182 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  31.97 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  31.97 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  31.97 
 
 
182 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3633  hypothetical protein  37.5 
 
 
226 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>