128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5166 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  100 
 
 
642 aa  1285    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4316  putative lipoprotein  41.83 
 
 
485 aa  289  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280453  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  55.47 
 
 
465 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27850  hypothetical protein  29.87 
 
 
547 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0523  putative lipoprotein  32.99 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0632  putative lipoprotein  32.99 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1351  hypothetical protein  32.74 
 
 
474 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.625365  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1554  putative lipoprotein  34.43 
 
 
489 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1579  putative lipoprotein  33.88 
 
 
474 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1742  hypothetical protein  33.88 
 
 
670 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  42.52 
 
 
492 aa  97.8  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  41.13 
 
 
472 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  40.32 
 
 
490 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  41.46 
 
 
380 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  31.88 
 
 
547 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  40.65 
 
 
801 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  43.9 
 
 
803 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  35.66 
 
 
374 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.8 
 
 
489 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.29 
 
 
493 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.91 
 
 
498 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  39.02 
 
 
451 aa  87.8  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  39.34 
 
 
489 aa  87.4  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  34.5 
 
 
548 aa  87  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  40.32 
 
 
461 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  35.71 
 
 
368 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  34.53 
 
 
516 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  31.01 
 
 
558 aa  84  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  37.19 
 
 
801 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  37.4 
 
 
801 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  31.67 
 
 
603 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  33.33 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.4 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  39.5 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.87 
 
 
933 aa  80.5  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  33.77 
 
 
535 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  32.28 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  34.31 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  32.74 
 
 
890 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  28.63 
 
 
589 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.01 
 
 
1072 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06480  hypothetical protein  29.64 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  33.58 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  30.54 
 
 
634 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  33.06 
 
 
414 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 
709 aa  72  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  29.75 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  36.97 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  33.11 
 
 
391 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.58 
 
 
794 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  28.78 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  28.06 
 
 
522 aa  66.6  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  31.97 
 
 
492 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.86 
 
 
627 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  33.8 
 
 
574 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  30.28 
 
 
417 aa  64.3  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  33.06 
 
 
384 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  34.96 
 
 
452 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  33.81 
 
 
494 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  41.1 
 
 
568 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10868  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
502 aa  61.2  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  33.61 
 
 
423 aa  61.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  34.62 
 
 
427 aa  60.8  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  29.55 
 
 
503 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  32.31 
 
 
482 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  28.66 
 
 
1207 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  31.17 
 
 
1016 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  32.28 
 
 
1577 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  38 
 
 
436 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01110  expressed protein  23.87 
 
 
665 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  31.71 
 
 
732 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.58 
 
 
618 aa  58.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.51 
 
 
756 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.91 
 
 
580 aa  57.8  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  36 
 
 
1128 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  29.56 
 
 
186 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  26.45 
 
 
496 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.34 
 
 
531 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.08 
 
 
737 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01540  expressed protein  23.61 
 
 
534 aa  54.7  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  32.31 
 
 
691 aa  53.9  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  32.1 
 
 
806 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  32.1 
 
 
806 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  32.1 
 
 
806 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  32.1 
 
 
806 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  32.1 
 
 
806 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.1 
 
 
806 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.1 
 
 
806 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.41 
 
 
943 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  32.65 
 
 
897 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0156  Ricin B lectin  25.52 
 
 
187 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151088  normal  0.0518201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30 
 
 
476 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.12 
 
 
815 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  37.66 
 
 
858 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  37.66 
 
 
858 aa  51.2  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  37.66 
 
 
858 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.33 
 
 
487 aa  51.2  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  31.48 
 
 
806 aa  50.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1639  hypothetical protein  22.73 
 
 
488 aa  50.8  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  37.66 
 
 
800 aa  50.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>