More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5142 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  71.16 
 
 		 923 aa  1274    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 889 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 953 aa  1884    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 		 928 aa  328  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  33.37 
 
 		 929 aa  241  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 927 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 928 aa  204  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  40.36 
 
 		 928 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  40.53 
 
 		 892 aa  197  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  36.09 
 
 		 909 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  38.48 
 
 		 884 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 950 aa  184  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  37.44 
 
 		 930 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 920 aa  171  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 918 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  37 
 
 		 919 aa  164  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 904 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 937 aa  161  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.85 
 
 		 937 aa  161  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  35.41 
 
 		 913 aa  161  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  36.36 
 
 		 934 aa  160  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  35.49 
 
 		 911 aa  160  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.6 
 
 		 937 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 894 aa  157  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 946 aa  157  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  39.74 
 
 		 903 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 925 aa  154  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  37.81 
 
 		 1064 aa  151  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  35.83 
 
 		 919 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.84 
 
 		 923 aa  146  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  35.28 
 
 		 913 aa  141  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  34.46 
 
 		 929 aa  140  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  36.36 
 
 		 961 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 916 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  35.7 
 
 		 923 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 938 aa  135  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  37.08 
 
 		 936 aa  135  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.11 
 
 		 917 aa  134  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  44.14 
 
 		 240 aa  134  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  34.85 
 
 		 913 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  34.24 
 
 		 884 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  34 
 
 		 905 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  34 
 
 		 927 aa  125  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 919 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  31.69 
 
 		 919 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  31.69 
 
 		 919 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  40.98 
 
 		 955 aa  107  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 940 aa  101  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  29.51 
 
 		 900 aa  101  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  30.21 
 
 		 919 aa  99  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 879 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.35 
 
 		 923 aa  98.2  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.35 
 
 		 997 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  35.87 
 
 		 916 aa  94.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  36.99 
 
 		 940 aa  94.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 910 aa  91.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  31.07 
 
 		 921 aa  91.3  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 995 aa  90.1  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  35.29 
 
 		 977 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 		 998 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 927 aa  88.6  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  34.03 
 
 		 915 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  36.18 
 
 		 922 aa  83.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  30.11 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 921 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  29.84 
 
 		 921 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  31.65 
 
 		 929 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 1000 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 900 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 959 aa  77  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  40.83 
 
 		 946 aa  75.5  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.91 
 
 		 967 aa  75.1  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.6 
 
 		 1422 aa  74.3  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 973 aa  73.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 881 aa  73.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  28.45 
 
 		 940 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  29.01 
 
 		 897 aa  72.4  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 948 aa  71.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 877 aa  71.6  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  29.93 
 
 		 910 aa  71.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  28.78 
 
 		 960 aa  71.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 894 aa  71.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.54 
 
 		 947 aa  71.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 189 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 881 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 881 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 876 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.08 
 
 		 1006 aa  68.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  35.22 
 
 		 952 aa  68.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.11 
 
 		 1666 aa  67.8  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  34.19 
 
 		 893 aa  67.8  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  27 
 
 		 1030 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.76 
 
 		 1075 aa  67  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.14 
 
 		 1118 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  24.94 
 
 		 1005 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  39.86 
 
 		 998 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 895 aa  65.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.31 
 
 		 992 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 983 aa  65.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.44 
 
 		 1429 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>