More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5127 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  100 
 
 
507 aa  1029    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  67.46 
 
 
500 aa  670    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  78.6 
 
 
507 aa  783    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  67.27 
 
 
497 aa  682    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  78.13 
 
 
507 aa  784    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  69.66 
 
 
502 aa  671    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  80 
 
 
505 aa  805    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  69.94 
 
 
499 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  70.91 
 
 
522 aa  707    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  61.08 
 
 
506 aa  633  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  59.6 
 
 
505 aa  628  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  59.72 
 
 
505 aa  623  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  62 
 
 
505 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5304  glycerol kinase  62.7 
 
 
507 aa  618  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  62.08 
 
 
504 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  64.17 
 
 
502 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  61.37 
 
 
498 aa  614  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  61.04 
 
 
498 aa  609  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  60.89 
 
 
501 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  61.4 
 
 
504 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  58.42 
 
 
514 aa  607  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  60.56 
 
 
503 aa  606  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  57.4 
 
 
505 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  59.27 
 
 
504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  59.15 
 
 
504 aa  598  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  60 
 
 
500 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  59.24 
 
 
499 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  59.36 
 
 
504 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  59.27 
 
 
499 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  58.12 
 
 
499 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  57.43 
 
 
499 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  61.17 
 
 
501 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  61.17 
 
 
501 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  58.76 
 
 
505 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  60.36 
 
 
510 aa  588  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  60.76 
 
 
501 aa  589  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  58.05 
 
 
504 aa  586  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  59.04 
 
 
499 aa  585  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  56.18 
 
 
505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  56.77 
 
 
510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  55.67 
 
 
503 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  56.37 
 
 
510 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  59.01 
 
 
509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  57.79 
 
 
507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  56.37 
 
 
510 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  59.11 
 
 
496 aa  567  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  57.34 
 
 
505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  56.37 
 
 
517 aa  558  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  59.17 
 
 
514 aa  557  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  55.6 
 
 
510 aa  548  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  56.57 
 
 
505 aa  545  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  56.77 
 
 
505 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  57.06 
 
 
506 aa  541  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  56.57 
 
 
505 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  56.37 
 
 
505 aa  544  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  55.98 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  56.37 
 
 
505 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  56.11 
 
 
505 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  51.81 
 
 
498 aa  528  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  52.76 
 
 
509 aa  528  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  51.21 
 
 
496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  50.1 
 
 
499 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  52.8 
 
 
505 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  50.6 
 
 
496 aa  513  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  49.1 
 
 
500 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  49.11 
 
 
500 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  48.91 
 
 
505 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  50.3 
 
 
496 aa  510  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  49.7 
 
 
499 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  49.5 
 
 
499 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  49.1 
 
 
500 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  48.9 
 
 
500 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  48.7 
 
 
500 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  49.1 
 
 
500 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  50 
 
 
497 aa  510  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  48.8 
 
 
499 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  49.5 
 
 
503 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  49.5 
 
 
518 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  49.5 
 
 
503 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  49.5 
 
 
500 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  52.41 
 
 
505 aa  508  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  49.5 
 
 
496 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  52.41 
 
 
496 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  49.5 
 
 
518 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  49.5 
 
 
518 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  48.52 
 
 
501 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  49.5 
 
 
518 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  49.5 
 
 
518 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  51.2 
 
 
498 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  52.41 
 
 
496 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  50.81 
 
 
499 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  50.4 
 
 
501 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  49.19 
 
 
496 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  48.5 
 
 
498 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  48.2 
 
 
507 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  51 
 
 
496 aa  501  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  51 
 
 
494 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  48.5 
 
 
498 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  48.99 
 
 
496 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  49.19 
 
 
496 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>